Собаки самых разнообразных окрасов. Это черный, черно-подпалый, соболиный, рыжий и палевый, сопряженные с пятнистостью и крапчатостью. Литтл (1957) предположил, что в породе встречается ген е. Шерсть гладкая и шелковистая. Встречаются две вариации: с обильной каймой и без нее. Последние, возможно, короткошерстные за счет L, тогда как первые несут гены ll, но с минимальной экспрессией по туловищу. Предполагается, что осветленные палевые собаки несут гены Ayи cch, и/или осветляющие руфус-полигены.
Окрас — Генотип
Черный — As-S-tt
Черно-подпалый — atatS-tt
Соболиный — Ay-S-tt
Рыжий — Ay-S-tt
Черно-белый — As-sp-tt
Триколор — atatsp-tt
Рыже-белый — Ay-sp-tt
Черно-белый с крапом — As-sp-T-
Самоед
Отсутствие любого пигмента в шерсти у этих темноглазых собак обусловлено, по-видимому, действием гена sw. В соответствии с Литтлем (1957) приблизительно 9% самоедов имеют небольшие пигментированные пятна, занимающие не более 10% поверхности туловища. Это говорит о том, что по крайней мере в США описанные Литтлем собаки имели swsw.
Предположено, что самоеды имеют генотип As-eeswsw. Кроссы самоедов с волче-серыми собаками, гетерозиготными по at, давали черно-белых собак. Кроссы с собаками, несущими Ebrдавали тигровых и палевых собак. Черные полосы тигровых собак были нормально пигментированы, тогда как желтый фон был очень осветлен, что говорит о наличии осветляющих руфус-полигенов.
Некоторые авторы склоны выделить для окраса самоеда отдельную аллель из альбино-серии. Но это мало вероятно. Наиболее явным кандидатом можно рассматривать узко выявленный аллель шиншилла cch. Генотип тогда можно предоставить следующим образом: cchcchee или ее с соответствующими руфус-полигенами.