Примеры реакций катализируемых ферментами
различных классов:
1. ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ - катализируют реакции окисления-восстановления:
Лактатдегидрогеназа (LDH, EC 1.1.1.27) катализирует превращение молочной кислоты (лактат) в пировиноградную (пируват):
СН3СН(ОН)СООН + NAD+ CH3COCООH + NAD H + H +
Систематические названия составляют по форме «донор: акцептор оксидоредуктаза». Например, лактат: НАД+ оксидоредуктаза для лактатдегидрогеназы (ЛДГ).
2. ТРАНСФЕРАЗЫ - катализируют реакции ПЕРЕНОСА ГРУППИРОВОК С ОДНОГО СОЕДИНЕНИЯ НА ДРУГОЕ:
Холинацетилтрансфераза, ЕС 2.3.1.6, систематическое название: ацетил-КоА: холин О-ацетилтрансфераза:
СH3CO -S-KoA + HO-СН2-СН2-N+(CН3)3 КоА-SH + СН3СОO-СН2-СН2-N+(CН3)3
Ацетилтрансфераза синтезирует лимонную кислоту из оксалоацетата (щавелевоуксусной кислоты, ЩУК) и молекулы Ацетил-КоА: ЕС 2.3.3.1, систематическое название ацетил-КоА: оксалоацетат С-ацетилтрансфераза (acetyl-CoA:oxaloacetate C-acetyltransferase [thioester-hydrolysing, (pro-S)-carboxymethyl forming]).
Систематические названия составляют по форме «донор: транспортируемая группа – трансфераза».
3. ГИДРОЛАЗЫ (фосфатазы, эстеразы, фосфолипазы) (разрыв связей с присоединением воды):
а) Дипептидаза расщепляет дипептид на две аминокислоты при участии воды:
H2N-CH(R)-CO - NH-CH(R')-COOH + H2O H2N-CH(R)-COOH + NH2-CH(R')-COOH
б) Холинэстераза (ЕС 3.1.1.7, ацетилхолин ацетилгидролаза) катализирует реакцию гидролиза сложного эфира холина и уксусной кислоты (ацетилхолина):
CH3COO-CH2-CH2-N+(CH3)3 + H2O CH3COOH + HO-CH2-CH2-N+(CH3)3
Наименование составляют по форме «субстрат-гидролаза».
4. ЛИАЗЫ (альдолазы, гидратазы-дегидратазы, синтазы, декарбоксилазы) (катализ реакций разрыва связей в субстрате без присоединения воды или окисления):
пируватдекарбоксилаза (ЕС 4.1.1.1, 2-кетокислоты карбокси-лиаза) катализирует расщепление пирувата до уксусного альдегида с отщеплением СО2:
CH3COCООH → CH3COH + СО2
карбоксилаза (плюс СО2)
дегидратаза (минус Н2О)
Цитрат-дегидратаза (ЕС 4.2.1.4, цитрат гидро-лиаза) катализирует отщепление-присоединение воды от лимонной кислоты с образованием аконитата и изоцитрата:
Фермент катализирует как прямые, так и обратные реакции.
синтаза (соединение двух мелких в один крупный)
Ферменты обозначают термином «субстрат-лиазы». Например, фумарат-гидратаза (систематическое название «L-малат-гидролаза») катализирует обратимое отщепление молекулы воды от яблочной кислоты с образованием фумаровой кислоты. В эту же группу входят декарбоксилазы (карбокси-лиазы), амидин-лиазы и др.
5. ИЗОМЕРАЗЫ (рацемазы, эпимеразы, мутазы) (внутримолекулярные перестройки).
Глюкозо-6-фосфат-изомераза (ЕС 5.3.1.9, D-глюкозо-6-фосфат кето-изомераза), например, превращает глюкозо-6-фосфат во фруктозо-6-фосфат и наоборот:
Систематическое название составляют с учетом типа реакции: «субстрат – цис-транс-изомераза». Если изомеризация включает внутримолекулярный перенос группы, фермент получает название «мутаза».
6. ЛИГАЗЫ (синтетазы, соединяют 2 части с использованием энергии распада АТФ). Реакции ферментов этого класса, как правило, необратимы.
Так, аспартат-синтетаза ( ЕС 6.3.1.1, L-аспартат: аммиак-лигаза (АМФ-образующая) при участии молекулы АТФ синтезирует аспарагин из аспарагиновой кислоты и аммиака:
К подклассу 6.1 относят ферменты, катализирующие образование связей С-О (в том числе Аминоацил-т-РНК-синтетазы), к подклассу 6.2- образование связей C-S, 6.3- связей C-N, 6.4- связей С-С и 6.5- связей Р-О.
Например, к подклассу 6.4 относится фермент пируваткарбоксилаза (ЕС 6.4.1.1, пируват: СО2-лигаза (АДФ-образующая), при участии которой происходит превращение пирувата в оксалоацетат:
СО2 + СН3-СО-СООН + АТФ HOOC - CH2-CO-COOH + АДФ + Н3РО4
Систематическое название их составляют по форме «X: Y лигаза», где X и Y обозначают исходные вещества. В качестве примера можно назвать L-глутамат: аммиак лигазу (рекомендуемое сокращенное название «глутаминсинтета-за»), при участии которой из глутаминовой кислоты и аммиака в присутствии АТФ синтезируется глутамин.
Дата добавления: 2015-08-06 | Просмотры: 3630 | Нарушение авторских прав
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
|