Эмпирическая иммунология возникла задолго до изучения механизмов иммунитета. Еще до нашей эры с целью защиты от заболевания острой формой оспы в Китае, Индии и других странах на кожу здоровых людей наносили содержимое оспенных пустул. Этот метод профилактики (инокуляция) не всегда давал желаемые результаты, а иногда сам вызывал развитие острой формы заболевания, и даже смерть.
Основоположником систематического изучения иммунитета является английский врач Эдвард Дженнер (XVIII век). Он заметил, что ухаживавшие за животными молочницы могут заболеть оспой коров, но после выздоровления практически не заражаются натуральной (человеческой) оспой. Это наблюдение позволило Э. Дженнеру обосновать и в 1796 г. успешно апробировать метод защиты человека от натуральной оспы с помощью прививок относительно неопасной оспы коров. С тех пор вакцинация (от лат. vacca - корова) широко применяется во всем мире.
Работы Э. Дженнера, создание голландским исследователем Антони Левенгуком достаточно совершенного микроскопа и последовавшие за этим открытия, позволили французскому ученому Луи Пастеру предположить, что микроорганизмы вызывают многие заболевания. Правильность этого мнения была доказана немецким врачом Робертом Кохом на примере распространенной в то время среди животных сибирской язвы (1876 г.).
Перечисленные факты и другие наблюдения, свидетельствовали о разной чувствительности животных даже одного вида к возбудителям инфекционных заболеваний. Это явилось основанием для предположения о наличии и возможности выработки в организме механизмов защиты его от инфекций. Такие механизмы были названы иммунитетом.
Первый целенаправленный поиск средств, создающих иммунитет к инфекции, был сделан Л. Пастером. Он заметил, что ослабленный возбудитель куриной холеры делает кур невосприимчивыми к данному заболеванию. Это позволило Л. Пастеру применить ослабленных возбудителей для борьбы с сибирской язвой у сельскохозяйственных животных (1881 г.), а также бешенством у собак и человека (1885 г.). К настоящему времени, на основе заложенных Л. Пастером принципов, созданы вакцины против большинства известных науке инфекционных заболеваний.
В 1883 г. Российский биолог Илья Мечников обнаружил способность клеток (фагоцитов) поглощать различные частицы. А немецкий фармаколог Пауль Эрлих, почти в это же время (1887 г.), доказал появление в сыворотке крови зараженных бактериями животных, белков (антител), способных убивать данные микроорганизмы. Эти факты и наблюдения других авторов позволили И. Мечникову разработать клеточную, а П. Эрлиху - гуморальную теории иммунной защиты.
Обнаружение Ж. Борде и Н. Чистовичем антител не только на микроорганизмы, создание И. Мечниковым учения об антителах против тканей организма и открытие (в 1901 г.) австрийским ученым Карлом Ландштейнером антигенов к эритроцитам явились предпосылкой для развития неинфекционной иммунологии.
К. Ландштейнер показал, что эритроциты имеют антигены (он их назвал агглютиногенами А и В), взаимодействие которых с определенными агглютининами (А с a или В с b) сыворотки приводит к склеиванию (агглютинации) эритроцитов. Следовательно, кровь особей одного вида животных по ее антигенному составу можно разделить на три группы. В 1903 г. чешский ученый Я. Янский обнаружил кровь, в которой имеются оба агглютиногена (А и В), но нет агглютининов к ним. Поэтому Я. Янский сделал вывод о том, что кровь особей одного вида животных по иммунологическим свойствам делится как минимум на четыре группы.
Перечисленные факты, а также изучение П. Медаваром реакций иммунной системы на чужеродный трансплантат и злокачественные новообразования, доказали, что иммунитет защищает организм как от поступающих из вне антигенов, так и от образующихся в нем, но отличающихся от его нормальных биологических структур.
Дальнейшее развитие иммунологии во многом обусловлено работами австралийского ученого Мак Фарлейн Бернета. Он рассматривал иммунитет как реакцию, направленную на дифференцировку «своего» и «чужого», а тимус и лимфоциты назвал обязательными участниками антигенспецифического ответа. Он также отметил значение иммунитета в индивидуальном (онтогенетическом) развитии, создал клонально-селекционную теорию иммунитета и предсказал наличие иммунной толерантности (это позднее доказано работами англичанина Питера Медавара и чешского ученого Милана Гашека).
Важным достижением во второй половине XX века явилось выяснение основных свойств и механизмов иммунитета. В настоящее время: расшифрована структура антител; изучены иммунокомпетентные клетки; в значительной степени стали ясны механизмы толерантности и распознавания антигена; обнаружены химические регуляторы межклеточных взаимодействий при иммунных реакциях (цитокины); доказана роль иммунитета в эволюции животных. Все это послужило основой для развития иммуногенетики, иммунологии онтогенеза, иммунопатологии, трансплантационного иммунитета и иммунологической толерантности, а инфекционная иммунология стала одним из направлений общей иммунологии.
Согласно современной концепции, сформулированной Российским ученым Рэмом Петровым, иммунная система проверяет биологические объекты внутри организма на наличие чужеродности. При обнаружении «чужих» антигенов она их запоминает, анализирует и реагирует выработкой специфичных к ним лимфоцитов и антител.