АкушерствоАнатомияАнестезиологияВакцинопрофилактикаВалеологияВетеринарияГигиенаЗаболеванияИммунологияКардиологияНеврологияНефрологияОнкологияОториноларингологияОфтальмологияПаразитологияПедиатрияПервая помощьПсихиатрияПульмонологияРеанимацияРевматологияСтоматологияТерапияТоксикологияТравматологияУрологияФармакологияФармацевтикаФизиотерапияФтизиатрияХирургияЭндокринологияЭпидемиология

Аннотация расшифрованной последовательности.

• Следует отметить, что последние версии программ настроены на поиск специфических черт открытых рамок: интронэкзонных сочленений, 3'полиА-сигналов и преимущественных кодонов. Например, аланин может кодироваться четырьмя кодонами, но в геноме человека кодон ГЦЦ встречается в 41% аланиновых кодонов, а ГЦГ только в 11%. Наиболее часто встречающиеся кодоны присутствуют в экзонах, но не встречаются в интронах и пространствах между генами.

• После обнаружения предполагаемых открытых рамок считывания для определения гена проводят поиск гомологичных последовательностей среди расшифрованных генов других организмов в базах данных (например, в Genbank).

• Следует отметить, что последние версии программ настроены на поиск специфических черт открытых рамок: интронэкзонных сочленений, 3'полиА-сигналов и преимущественных кодонов. Например, аланин может кодироваться четырьмя кодонами, но в геноме человека кодон ГЦЦ встречается в 41% аланиновых кодонов, а ГЦГ только в 11%. Наиболее часто встречающиеся кодоны присутствуют в экзонах, но не встречаются в интронах и пространствах между генами.

• После обнаружения предполагаемых открытых рамок считывания для определения гена проводят поиск гомологичных последовательностей среди расшифрованных генов других организмов в базах данных (например, в Genbank).

• На сегодняшний день завершена расшифровка последовательностей нескольких десятков геномов прокариот и эукариот. Поскольку прокариоты имеют маленький геном, подходящий для клонирования генов методом дробовика, то для более 100 видов геномы уже расшифрованы и анализ более 500 находится в стадии завершения. Размеры геномов и количество генов у некоторых прокариот приведены ниже в таблице 1

• На основе полученных результатов установлено, что размеры геномов простейших относительно малы (в основном менее 5 мегабаз), но широко варьируют от больших геномов бактерий (30 мегабаз у Bacillusmegaterum) до маленьких геномов эукариот (12 мегабаз у дрожжей). Большинство исследованных геномов прокариот организованы в кольцевые молекулы ДНК. Однако, Borreliaburdoferi – возбудитель болезни Лайма у человека и некоторые виды Streptomyces имеют геномы в виде линейной ДНК.

• Еще одной характерной чертой геномов бактерий оказалась очень высокая плотность генов, которая составила в среднем 1 на 1000 пар оснований (табл. 1). Причем, такая плотность присуща и E. coli с относительно большим геномом 4,6 мегабаз (4397 генов) и М. gentialum с самым маленьким геномом 0,6 мегабаз (503 гена). Плотно расположенные гены у бактерий обуславливают высокую пропорцию ДНК, кодирующую белки (85-90 %). Интересно, что только 1% бактериальной ДНК является некодирующей и чаще всего она представлена в форме транспозонов – элементов, которые могут перемещаться по геному. Интроны в бактериальных геномах практически отсутствуют.

Необходимо подчеркнуть важное свойство бактериальных геномов, связанное с тем, что большая часть генов у них локализуются совместно и являются полицистронными транскрипционными единицами, имеющими общий промотор и регулятор. Такая структура регуляции была открыта в ходе исследования метаболизма лактозы у E. coli еще в начале 60-х и получила название оперона. В настоящее время установлено, что в геноме E. coli около 600 транскрипционных единиц являются оперонами. Структура и размер генома

Известно, что ДНК, которая является носителем генетической информации у большинства организмов и, следовательно, составляет основу генома, включает в себя не только гены в современном смысле этого слова.

Большая часть ДНК эукариотических клеток представлена некодирующими («избыточными») последовательностяминуклеотидов, которые не заключают в себе информации о белках и РНК.

Генетическая информация в клетках содержится не только в хромосомах ядра, но и во внехромосомных молекулах ДНК. Убактерий к таким ДНК относятся плазмиды и некоторые умеренные вирусы, в клетках эукариот — это ДНК митохондрий,хлоропластов и других органоидов клеток (См. плазмон).

Объёмы генетической информации, заключённой в клетках зародышевой линии (предшественники половых клеток и самигаметы) и соматических клетках, в ряде случаев существенно различаются. В онтогенезе соматические клетки могут утрачивать часть генетической информации клеток зародышевой линии, амплифицировать группы последовательностей и (или) значительно перестраивать исходные гены.

Следовательно, под геномом организма понимают суммарную ДНК гаплоидного набора хромосом и каждого из внехромосомных генетических элементов, содержащуюся в отдельной клетке зародышевой линии многоклеточного организма.

В определении генома отдельного биологического вида необходимо учитывать, во-первых, генетические различия, связанные с полом организма, поскольку мужские и женские половые хромосомы различаются.

Во-вторых, из-за громадного числа аллельных вариантов генов и сопутствующих последовательностей, которые присутствуют вгенофонде больших популяций, можно говорить лишь о некоем усреднённом геноме, который сам по себе может обладать существенными отличиями от геномов отдельных особей.

Дата добавления: 2015-10-20 | Просмотры: 463 | Нарушение авторских прав