Тело сплющено в дорсо-вентральном направлении, форма тела чаще всего листовидная или грушевидная, иногда ланцетовидная. Величина колеблется от 0,1 мм до 15-20 см. С поверхности тело покрыто кутикулой (имеется у всех гельминтов). Под ней располагается мышечный слой (кутикула + мышцы = кожно-мышечный мешок). Внутри располагаются внутренние органы.
Органы фиксации:
1. Присоски. У большинства трематод выражено 2 присоски: ротовая и брюшная. Ротовая находится на переднем конце тела, брюшная – на вентральной стороне тела, но в разных его частях.
2. Шипики на поверхности кутикулы.
Внутреннее строение:
Пищеварительная система. На дне ротовой присоски располагается ротовое отверстие. Оно переходит в мышечный орган (глотку). Затем глотка переходит в пищевод, сравнительно короткий. Пищевод делится на две кишечные ветви, которые тянутся по бокам тела до заднего конца. Заканчиваются слепо, т.е. анального отверстия нет. Питаются кровью, слизью, клетками эпителия.
Выделительная система состоит из сложной сети канальцев, начинающихся в различных участках тела. Потом эти многочисленные канальцы объединяются в два боковых ствола, которые в задней части тела сливаются в один непарный канал, который открывается наружу выделительным отверстием.
Нервная система представлена окологлоточным нервным кольцом и отходящими от него продольными нервными стволами.
Половая система. Почти все трематоды, за исключением самого последнего подотряда, являются гермафродитами. Половая система сильно развита, устроена довольно сложно.
Мужской половой аппарат включает в себя семенники (2), семяпроводы, общий семявыносящий проток (канал). Конечная часть общего семявыносящего протока у многих трематод образует расширение в виде мешка (мужская половая бурса). Мужская половая система открывается во внешнюю среду мужским половым отверстием. Оно открывается на вентральной стороне тела.
Женская половая система: яичник (1), яйцевод, оотип, матка, желточники, тельце Мелиса, семяприемник (не у всех), желточные протоки, Лауреров канал. Яичник выделят яйцевые клетки, которые через яйцевод попадают в оотип. Здесь происходит процесс оплодотворения яйцеклеток и формирования яиц. Матка имеет вид сильно извитой трубки. Одним концом матка впадает в оотип, вторым сообщается с внешней средой посредством наружного женского полового отверстия. Женское половое отверстие находится на вентральной стороне тела рядом с мужским. Желточники представляют собой гроздевидные железы, расположенные по бокам тела. Они выделяют специальный секрет, необходимый для формирования яиц (питательные вещества). Желточники желточными протоками сообщаются с оотипом. Лауреров канал служит для удаления излишка желточных клеток. К оотипу примыкает тельце Мелиса. Оно выделяет жидкий секрет, который омывает половые пути и способствует свободному скольжению яиц. В семяприемнике находятся запасы спермы.