В структурном отношении антиген состоит из 2-х частей - высокомолекулярного носителя и низкомолекулярной антигенной детерминанты (эпитопа).
Носителем является белок или полисахарид, а детерминантами специфичности - различные простые соединения, кислотные радикалы, концевые моносахариды и др. (важная роль принадлежит группировкам - -СООН, -ОН).
Роль носителя состоит в стабилизации стереохимической структуры детерминанта в положении наиболее выгодном для соединения с рецепторной группой антитела (паратопом).