1. Разрушение микробных клеток в механическом дезинтеграторе. В специальные нейлоновые стаканы помещают взвесь клеток (1 млрд/мл), на каждый миллилитр которой добавляют 1 г бус диаметром 0.15 мм, изготовленных из пирекс-стекла. Стакан вращается приводом электродвигателя со скоростью 3000 об/мин. Разрушение клеточных стенок бактерий наступает через 10—20 мин. Разница в экспозиции зависит от вида бактерий.
2. Разрушение клеток в прессах высокого давления. Продавливают замороженную при 30-70°С микробную массу через узкую щель под давлением в 2000 атм. При переходе бактерий из зоны высокого давления пресс-аппарата в зону атмосферного давления их клеточная стенка разрушается. Процедуру повторяют 3—4 раза. Метод является более щадящим, чем встряхивание с бусами.
3. Ультразвуковой метод дезинтеграции. Применяют генераторы, излучающие волны частотой не более 10—20 кГц и мощностью 60—100 вт. Экспозиция озвучивания зависит от вида и формы микробной клетки и колеблется от 10 до 60 минут.
4. Разрушить бактериальную клетку можно и детергентами (лаурилсульфат натрия, дезоксихолат натрия). На 1 мл взвеси бактерий добавляют 1—1,5% детергента. Экспозиция зависит от вида бактерий и подбирается опытным путем.
После дезинтеграции бактериальных клеток одним из методов из взвеси выделяют жгутики, капсульное вещество, клеточные стенки, мембраны, цитоплазматические компоненты.