АкушерствоАнатомияАнестезиологияВакцинопрофилактикаВалеологияВетеринарияГигиенаЗаболеванияИммунологияКардиологияНеврологияНефрологияОнкологияОториноларингологияОфтальмологияПаразитологияПедиатрияПервая помощьПсихиатрияПульмонологияРеанимацияРевматологияСтоматологияТерапияТоксикологияТравматологияУрологияФармакологияФармацевтикаФизиотерапияФтизиатрияХирургияЭндокринологияЭпидемиология

ВВЕДЕНИЕ. Вирусы открыты в конце прошлого столетия Бейеринком и Д.И.Ивановским (1892 г

Прочитайте:
  1. ВВЕДЕНИЕ.
  2. Введение.
  3. Введение.
  4. Введение.
  5. Введение.
  6. Введение.
  7. Введение.
  8. Введение.
  9. ВВЕДЕНИЕ.
  10. Введение.

Вирусы открыты в конце прошлого столетия Бейеринком и Д.И.Ивановским (1892 г. - вирус табачной мозаики), Лефлером и Фрошем (1897 г. - вирус ящура) и Ридом и Кэрролом (1898 г. - вирус желтой лихорадки) на основе измерения их единственной физико-химической характеристики - способности проходить через стерилизующие керамические фильтры, т.е. фильтруемости. Именно это свойство первоначально использовалось для их классификации в качестве отдельной, особой группы патогенных микроорганизмов. Слово вирус (virus), которым были названы новые агенты, в исходном смысле означало заразный яд и исторически в научном контексте впервые было применено врачом эпохи Возрождения Петрусом Форестусом (1522-1597). Окончательное определение вирусов как организмов и генетически обособленных индивидуумов дано А.Львовым (1957, 1962 гг.). Вирусы составляют условное «третье царство» Vira, наряду с царствами про- и эукариотов.

В предлагаемом учебном пособии представленны наиболее характерные и значимые для человека, вирусы из основных семейств.

Семейство: Rhabdoviridae.

Таксономическая структура семейства.

Семейство: Rhabdoviridae

Род: Vesiculovirus Lyssavirus Ephemerovirus Novirhabdovirus Cytorhabdovirus Nucleorhabdovirus.

Характеристика вириона. Морфология. Вирион имеет пулевидную или конусовидную форму (длина 100-430 нм; диаметр 45-100 нм). Вирусы, инфицирующие растения имеют бациллоподобную, пулевидную форму или плеоморфны. Внешняя поверхность вириона покрыта выступами (пепломерами) длиной 5-10 нм и диаметром 3 нм, образованными тримерами гликопротеина G. Нуклеокапсид 30-70 нм в диаметре, спиральной симметрии, окружен липопротеидной оболочкой, имеющий длину в развернутом виде 700 нм и диаметр 20 нм (см. приложение, рис. 30-33). Нуклеокапсид представляет собой комлекс РНК и протеина N, вместе с протеинами L и Р. Гликопротеин G, входящий в состав липидной оболочки, взаимодействует с нуклеокапсидом через протеин М. Нуклеокапсид инфекционен и проявляет транскриптазную активность.

Mr (вирион) 300-1000 x 106; плавучая плотность в CsCl 1,19-1,20 г/см3, в сахарозе – 1,17-1,19 г/см3; S20w 550-1045S (у рабдовирусов растений это значение выше).

Инфекционность вируса резко снижается при 56 оС, УФ или рентгеновском облучении, при обработке жирорастворителями.

Геном. РНК односпиральная, линейная, с негативной полярностью; размер 11-15 kb; Mr 4,2-4,6 x 106; 1-2% от веса частицы. РНК неполиаденилирована, имеет 5’-концевой трифосфат. Концы содержат инвертированные комплементарные последовательности. При выделении РНК из вирусной популяции могут обнаруживаться дефектные РНК, которые обычно значительно короче полноразмерных (более чем в 2 раза), с негативной полярностью, иногда имеющие шпилечную структуру. Дефектные вирусы могут репродуцироваться только в присутствии гомологичных или реже гетерологичных рабдовирусов-помощников, содержащих функциональные гены. Полноразмерная РНК с позитивной полярностью встречается в общей РНК-популяции вирусов в 5% случаев. Другие компоненты вириона. Вирионы имеют в своем составе 5 структурных полипептидов, обозначаемых L, G, N, P и М. Протеин L (Mr 220-240 x 103; наблюдаемый размер в SDS-PAGE 150-190 x 103) является компонентом вирусного нуклеокапсида, принимает участие в транскрипции и репликации. Проявляет активность РНК-зависимой РНК полимеразы и протеинкиназы. Протеин G (Mr 220-240 x 103) образует поверхностные пепломеры. Протеин G гликозилирован по N-связям. Участвует в проникновении вируса в клетку (прикрепление к клеточным рецепторам, слияние мембран и эндоцитоз), индуцирует образование вируснейтрализующих антител и клеточно-опосредованного иммунного ответа. Проявляет гемагглютинирующую активность. Протеин N (Mr 47-62 x 103) является мажерным компонентом вирусного нуклеокапсида, ассоциированным с полноразмерной РНК (негативной или позитивной полярности, с дефектными, но не с мРНК). Вновь синтезированные молекулы протеина N участвуют в регуляции транскрипции генома, репликации и считывании сигналов терминации транскрипции и полиаденилирования. Индуцирует развитие клеточно-опосредованного иммунного ответа и образование антител. Протеин Р (Mr 20-30 x 103) является компонентом вирусной полимеразы. Он фосфорилирован и имеет размер в SDS-PAGE 40-50 x 103. Растворимая форма обнаруживается в цитоплазме инфицированных клеток. Участвует в транскрипции; может предотвращать самоагрегирование протеина N и принимать участие в его ассоциации с РНК. Участвует в развитии клеточно-опосредованного иммунного ответа. Протеин М (Mr 20-30 x 103) является основным внутренним компонентом вириона. В некоторых случаях фофорилирован. Связан с нуклеокапсидом и цитоплазматическим доменом гликопротеина G. Участвует в регуляции транскрипции геномной РНК, ингибирует транскрипцию клеточной ДНК (обнаруживается в ядрах клеток).

Структурные протеины составляют 65-75% сухого веса вирусных частиц. Для протеинов некоторых вирусов ранее использовалась другая номенклатура: протеин Р (NS, M1 или M2) и протеин М (М1 или М2). Для вируса везикулярного стоматита Индиана (Vesicular stomatitis Indiana virus, VSIV) определено следующее количество молекул протеинов в одной вирусной частице: L 20-50; G 500-1500; N 1000-2000; P 100-300; M 1500-4000. Для вирионов описан ряд видов активности, соответствующих следующим ферментам: РНК транскриптаза (L и Р), 5’-кэпирующий энзим, гуанил- и метилтрансферазы, протеинкиназа (кодируемая вирусом или клеткой), нуклеозидтрифосфатаза и нуклеозиддифосфаткиназа. Вероятно, данными свойствами обладает протеин L. Функции других протеинов рабдовирусов не ясны. Вирионы состоят на 15-25% из липидов, производных клеточной мембраны, через которую происходило почкование вируса. Фосфолипиды составляют 55-60%, стеролы и гликолипиды – 35-40% всех липидов. Углеводы составляют 3% сухого веса частицы. Они представлены в виде N-связанных гликановых цепей протеина G и гликолипидов. В клетках млекопитающих, в отличие от клеткок насекомых, олигосахаридные цепи обычно сложного типа.

Организация генома и репликация. Вирусы имеют не менее 5 ORFs располагающиеся в геноме с негативной полярностью в следующем порядке (для VSIV): 3’-N-P-M-G-L-5’. Для некоторых вирусов определены дополнительные гены. Гены транскрибируются как 5’-кэпированные и 3’-полиаденилированные моноцистронные мРНК. Для некоторых вирусов описаны полицистронные мРНК. Короткая некэпированная, неполиаденилированная и нетранслируемая “лидерная” мРНК, комплементарно соответствующая 3’-концу вирусной РНК (например, предшествующая N мРНК) также транскрибируется. В отличие от мРНК она имеет 5’-трифосатированный конец. Данная РНК обнаруживается в ядре инфицированных клеток. Для отдельных вирусов показано, что мРНК обычно имеет общую 5’-концевую последовательность (m7Gppp(m)AmA(m)CA). Межгенные сиквенсы обычно короткие, реже могут достигать в длину до 50 нуклеотидов. В некоторых случаях 5’-конец мРНК может перекрывать 3’-конец предыдущего гена. Адсорбция вируса начинается с прикрепления протеина G к поверхностным клеточным рецепторам, что приводит к его проникновению внутрь клетки путем эндоцитоза. После проникновения вирусная оболочка удаляется за счет лизосомной активности и транскрипционно активный нуклеокапсид (РНК, N, L, P) оказывается в цитоплазме. Вирусная РНК транскрибируется (первичная транскрипция) вирусной транскриптазой в кэпированные полиаденилированные мРНК, которые транслируются в цитоплазматических полисомах. Трансляция G мРНК происходит на мембраносвязанных полисомах. После трансляции мРНК, в цитоплазме происходит репликация РНК (синтез полноразмерных позитивных и негативных цепей РНК). У некоторых видов мРНК рабдовирусов растений репликация РНК происходит в ядре клетки. Для репликации необходимы вновь синтезированные протеины N, P и L, участвующие в формировании промежуточных репликативных комплексов. После репликации происходят следующие раунды транскрипции (вторичная транскрипция), трансляции и репликации.

Посттрансляционные события протеина G включают транспортировку через мембраны эндоплазматического ретикулума, удаление аминоконцевой сигнальной последовательности и гликозилирование в аппарате Гольджи. В зависимости от клеток, протеин G может двигаться к плазматической мембране, особенно к базолатеральной поверхности поляризованных клеток. Сборка вирусных нуклеокапсидных структур происходит в ассоциации протеина М и липидных оболочек, содержащих протеин G. Место формирования частиц зависит от вируса и клетки-хозяина. У везикуло-, лисса-, эфемеро- и новирабдовирусов нуклеокапсиды синтезируются в цитоплазме, и вирусы почкуются через плазматическую мембрану большинства, но не всех, клеток. Некоторые лиссавирусы почкуются преимущественно через внутрицитоплазматические мембраны, образуя, в некоторых случаях, вирусспецифические цитоплазматические включения, содержащие протеин N (тельца-включения вируса бешенства, называемые тельца Негри). Циторабдовирусы почкуются через внутрицитоплазматические мембраны, ассоциированные с вироплазмами. Нуклеорабдовирусы почкуются через внутреннюю ядерную мембрану и накапливаются в перинуклеарном пространстве. В зависимости от вируса и клетки-хозяина, может наблюдаться ингибирование синтеза клеточных макромолекул, но механизм этого не ясен.

Шесть родов были идентифицированы на основе значительных различий в организации генома, аминокислотных сиквеснов структурных протеинов, очагов репликации и по спектру восприимчивых хозяев. Анализ филогенетического родства на основе доступных сиквенсов протеинов N, G и L позволяет отнести тот или иной вид в один из родов.

Антигенные свойства. Протеин G участвует в нейтрализации и определяет серотип вируса. Протеин N проявляет свойства комплементсвязывающего антигена с перекрестной активностью. Между вирусами, относящимися к разным родам может проявляться слабая перекрестная серологическая активность. Защита может быть достигнута с использованием вакцин на основе аттенуированного или инактивированного вируса, субъединиц, имеющих протеин G (один или в комплексе с рибонуклеопротеидом), или векторов, экспрессирующих протеины G или N.

Биологические особенности. Виды вирусов данного семейства инфицируют млекопитающих, рыб, членистоногих и беспозвоночных. Некоторые представители имеют как позвоночных, так и беспозвоночных хозяев. Отдельные вирусы инфицируют растения и определённые виды растительноядных насекомых. Некоторые вирусы позвоночных имеют широкий спектр восприимчивых хозяев. Многие культуры клеток из тканей позвоночных и беспозвоночных восприимчивы к рабдовирусам позвоночных in vitro. Вирусы растений обычно имеют узкий спектр хозяев среди высших растений, некоторые реплицируются в насекомых (векторах) и накапливаются в культурах клеток насекомых. Вирус сигма (Sigma virus, SIGMAV) впервые был идентифицирован как агент, вызывающий конгенитальную инфекцию у дрозофил (Drosophila). Вертикальной передачи рабдовирусов не наблюдается. Некоторые вирусы растений переносятся механически. В качестве векторов могут быть москиты, мухи, клещи, комары, тля, прыгунки и т.п. Некоторые вирусы могут передаваться механически с жидкостями инфицированного организма. Распростр вирусов позвоночных может быть контактным, аэрозольным, через укус, при половом контакте.

Род: Vesiculovirus. Типовой вид: Vesicular stomatitis Indiana virus (VSIV) (вирус везикулярного стоматита Индиана).

Характерные особенности. Везикуловирусы имеют 5 мажерных полипептидов (L, G, N, P и M). Геном (11,2 kb) включает лидерную последовательность (50 нуклеотидов) предшествующую N, нетранслируемый участок (60 нуклеотидов), следующий за L, и межгенные последовательности. Общие сиквенсы обнаружены перед каждой межгенной последовательностью (3’-AUACUUUUUUU), в начале каждого гена (UUGUCNNUAG) и после межгенных сиквенсов, являющиеся 5’-концами, следующих видов мРНК (обычно m7Gppp(m)Am-A(m)CAGNNAUC…).

Биологические особенности. Вирусы данного рода были выделены от различных животных, включая млекопитающих, рыб и членистоногих (насекомых). Везикулярный стоматит лошадей, КРС, свиней является одной из давно известных болезней (впервые была описана и дифференцирована от ящура в начале 19 века). Вспышки болезни периодически отмечаются в западном полушарии. Болезнь проявляется хромотой у лошадей и свиней, и потерей молочной продуктивности – у коров. Ряд везикуловирусов (Chandipura virus, CHPV; Cocal virus, COCV; Isfahan virus, ISFV; Piry virus, PIRYV; Vesicular stomatitis Alagoas virus, VSAV; Vesicular stomatitis Indiana virus, VSIV; Vesicular stomatitis New Jersey virus, VSNJV) также инфицируют человека. В районах, где данные вирусы эндемичны, часто обнаруживаются антитела к ним у людей, живущих в сельской местности. Естественное или лабораторное инфицирование сопровождается гриппоподобными симптомами. Многие везикуловирусы, инфицирующие млекопитающих, были выделены от естественно инфицированных членистоногих (phlebotomine sandfly), что предполагает их арбовирусную природу. Некоторые везикуловирусы вызывают эпизоотии среди рыб и могут передаваться их эктопаразитами.

Критерии подразделения на виды внутри рода. Представители данного рода проявляют перекрестную активность в РСК и реакции иммунофлюоресценции; перекрестная нейтрализация проявляется слабо или не проявляется. Сравнение сиквенса геномов показало их сходство. Гомология сиквенсов протеина N между видами составляет 49% (HCPIV и VSNJV) и 68,9% (VSIV и VSNJV). Виды (9 видов):

Название вида вируса Название на русском языке № генома Аббревиатура
Carajas virus Вирус Караджас -- CJSV
Chandipura virus Вирус Чандипура J04350; M16608; V01208 CHPV
Cocal virus Вирус Кокал V01208 COCV
Isfahan virus Вирус Исфахан -- ISFV
Maraba virus Вирус Мараба -- MARAV
Piry virus Вирус Пири Z15093, D26175, M14719, M14714, V01208 PIRYV
Vesicular stomatitis Alagoas virus Вирус везикулярного стоматита Алагоас -- VSAV
Vesicular stomatitis Indiana virus Вирус везикулярного стоматита Индиана J02428 VSIV
Vesicular stomatitis New Jersey virus Вирус везикулярного стоматита Нью Джерси K02379, S61075, J02433, M20166, M14553, K02747 VSNJV

Предполагаемые виды (19):

BeAn 157575 (BeAnV-157575) Boteke virus (BTKV) Calchaqui virus (CQIV) Eel virus American (EVA) Gray lodge virus (GLOV) Jurona virus (JURV) Klamath virus (KLAV) Kwatta virus (KWAV) La Joya virus (LJV) Malpais Spring virus (MSPV) Mount Elgon bat virus (MEBV) Perinet virus (PERV) Pike fry rhabdovirus (Grass carp rhabdovirus) (PFRV) Porton virus (PORV) Radi virus (RADIV) Spring viremia of carp virus (SVCV) Tupaia virus (TUPV) Ulcerative disease rhabdovirus (UDRV) Yug Bogdanovac virus (YBV).

Род: Lyssavirus. Типовой вид: Rabies virus (RABV) (вирус бешенства).

Характерные особенности. Лиссавирусы (например, вирус бешенства) имеют 5 мажерных полипептидов: L (Mr 190 x 103), G (Mr 65-80 x 103), N (Mr 58-62 х 103), P (Mr 35-40 x 103) и M (Mr 22-25 x 103). Протеин G вируса бешенства может быть гликозилирован только по двум из трех сайтов для N-связанных гликанов. N и Р – фосфопротеины. Геном вируса бешенства (11,9 kb) включает 3’-концевую последовательность (60 нуклеотидов) предшествующую N; нетранслируемый участок (70 нуклеотидов), следующий за L; межгенные ди- или пентануклеотиды, или спейсер (423 нуклеотида) между G и L штамма PV вируса бешенства. У исследованных лиссавирусов межгенные сиквенсы сходны с таковыми везикуловирусов. В нейронах вирус Б индуцирует образование телец Негри.

Биологические особенности. Бешенство энзоотично во всех регионах мира кроме Антарктики. Великобритания, Ирландия и Япония свободны от бешенства. Резервуаром инфекции в природе являются многие виды летучих мышей, скунсы, мангусты, еноты, лисы, волки, шакалы, собаки и др. Во многих регионах важной проблемой остается передача инфекции от собак человеку. Передача вируса происходит, как правило, при укусе со слюной (описаны случаи передачи инфекции при трансплантации роговицы). Вирус бешенства нейротропен, репродуцируется в нейронах, и клетках других органов (например, слюнных желез) позвоночных. В клетках, инфицированных вирусом бешенства, не ингибируется синтез клеточных макромолекул.

Критерии подразделения на виды внутри рода. Антигенные сайты протеина N проявляют перекрестнуюактивность в реакции связывания комплемента и реакции иммунофлюоресценции, и дают возможность идентифицировать представителей данного рода. Антигенные сайты протеина G, распознаваемые в реакции нейтрализации, позволяют идентифицировать вид изолята. Перекрестная нейтрализующая активность антител, специфичных вирусу бешенства, может быть средней (в отношении European bat lyssavirus 1, EBLV-1; European bat lyssavirus 2, EBLV-2; Duvenhage virus, DUVV) или очень низкой (в отношении Lagos bat virus, LBV; Mokola virus, MOKV). Эти данные, вместе с данными, полученными на основе моноклональных антител, позволяют подразделить род на 4 серотипа (1 - Rabies virus (RABV), 2 - Lagos bat virus, LBV, 3 - Mokola virus, MOKV и 4 - Duvenhage virus, DUVV) и 2 биотипа лиссавирусов европейских летучих мышей (EBLV-1 и EBLV-2). Генетический анализ некоторых участков генома (N, P и G) в совокупности с данными по антигенным совйствам, позволил подразделить представителей рода на 7 геногрупп (1- RABV, 2 - LBV, 3 - MOKV, 4 - DUVV, 5 - EBLV-1, 6 - EBLV-2, 7 - ABLV). Гомология по аминокислотному сиквенсу протеина М варьирует от 78% (MOKV и EBLV-2) до 93% (DUVV и EBLV-1).

Вирусы Kotonkon и Obodhiang, входившие ранее в состав рода, теперь считаются как неклассифицированные, так как данные, полученные на основе серологических и молекулярно-биологических исследований свидетельствуют об их родстве с представителями рода Ephemerovirus. Виды (7 видов):

Название вида вируса Название на русском языке № генома в генбанке Аббрев-ра
Australian bat lyssavirus Лиссавирус Австралийских летучих мышей AF006497 ABLV
Duvenhage virus Вирус Дювенхейдж U89483, U22848, AF049115, AF049120 DUVV
European bat lyssavirus 1 Лиссавирус Европейских летучих мышей 1 U22844, U22845, AF049113, AF049117 EBLV-1
European bat lyssavirus 2 Лиссавирус Европейских летучих мышей 2 U22846, U22847, AF049121 EBLV-2
Lagos bat virus Вирус Лагос бат (летучих мышей Лагос) U22842, AF049114, AF049119 LBV
Mokola virus Вирус Мокола D00491, D00492, D13766, D13767, S59447, S59448, U22843, U17064 MOKV
Rabies virus Вирус бешенства D10499, D10482,D42112, J02293, L04522-3, L20672, L40426, M13215 RABV

Предполагаемые виды (1): Rochambeau virus (RBUV).

Род: Ephemerovirus. Типовой: Bovine ephemeral fever virus (BEFV) (вирус эфемерной лихорадки КРС).

Характерные особенности. Вирион пуле- или конусовидной формы (длина 140-200 нм, диаметр 60-80 нм); плавучая плотность в CsCl 1,19 г/см3, S20w 625 S. Вирион наиболее стабилен при рН 7-8, чувствителен к кислой и щелечной среде. Частицы вируса эфемерной лихорадки КРС (BEFV) содержат не мнее 5 структурных протеинов: L (Mr 180x103), G (Mr 81x103), N (Mr 52х103), P (Mr 43x103) и M (Mr 29x103). Протеин G может быть гликозилирован по пяти сайтам N-связывания. Протеины N и М – фосфорилированы. В клетках, инфицированных BEFV, обнаружен дополнительный, не входящий в состав вириона, сильно гликозилированный протеин GNS (Mr 90 x 103). Между протеинами G и GNS обнаруживается гомология, проявляющаяся в меньшей степени с протеином G других рабдовирусов позвоночных. У Adelaide River virus (ARV) протеин G (Mr 90x103) содержит 6 сайтов гликозилирования (по N-связям), а протеин GNS – 9. Два гликопротеина были адентифицированы в клетках млекопитающих, инфицированных Berrimah virus (BRMV).

Геном BRMV (14,9 kb) содержит 10 генов (в порядке: 3’-N-P-M-G-GNS-a1-a2-b-g-L-5’) и межгенные участки по 26-53 нуклеотида. Гены g и L перекрываются на 21 нуклеотид. Дополнительные альтернативных ORFs могут быть на рамках генов Р и a2. Каждый ген, кроме a1, начинается с последовательности UUGUCC (мРНК: 5’-cap-AACAGG…) и заканчивается в предполагаемом сайте полиаденилирования (GNAV(U6-7)-3’).

У ARV нет гена g, а межгенные участки представлены 1-4 нуклеотидами. Гены b и L перекрываются на 22 нуклеотида. Дополнительная ORF может быть на альтернативной рамке гена Р. Каждый ген инициируется с вирусной последовательности UUGUC (мРНК: 5’-cap-AACAG…), однако предполагаемые сигналы полиаденилирования более вариабельны (по сравнению с BEFV), что может отражаться на синтезе полицистронных мРНК. Между протеинами a1, a2 и b ARV и BEFV прослеживается гомология.

Протеин G BEFV имеет 4 сайта вирусной нейтрализации. Очищенный или рекомбинантный протеин G защищает КРС от инфекции. Протеин GNS не индуцирует образование вируснейтрализующих антител и не обладает протективной активностью.

Биологические особенности. Эфемерная лихорадка КРС является экономически значимой болезнью КРС и водяных буйволов (water buffalo) в тропических и субтропических регионах Африки, Австралии, Среднего Востока и Азии. Инфекция, вызванная BEFV, проявляется внезапной лихорадкой и рядом других клинических признаков, таких как хромота, анорексия, нарушение моторики рубца, и длительным снижением молочной продуктивности. Хотя уровень смертности низок (1-2%), он выше у высокопродуктивных пород КРС. BEFV – арбовирус (распространяется кровососущими членистоногими, в которых может репродуцироваться), выделен от комаров и москитов.

Другие вирусы рода не ассоциируются с патологией животных, хотя некоторые были выделены от КРС (ARV и BRMV) и насекомых (Kimberley virus, KIMV; Malakal virus, MALV; Puchong virus, PUCV).

Критерии подразделения на виды внутри рода. Между видами перекрестная активность в реакции нейтрализации проявляется слабо или не проявляется вовсе. Сильная перекрестная активность наблюдается в реакции связывания комплемента и реакции иммунофлюоресценции. В реакции непрямой иммунофлюоресценции может отмечаться слабая перекрестная активность с лиссавирусами. Однако сравнительный анализ сиквенсов вирусов данного рода и других рабдовирусов показал наибольшую эволюционную близость эфемеровирусов с везикуловирусами. Анализ аминокислотных сиквенсов BEFV и ARV показал высокую стпень гомологии многих соответствующих протеинов, с наибольшей гомологией у протеинов L и N, и несколько меньшей – у G. По протеину N идентичность составляет 48%. Для других вирусов данных по аминокислотным сиквенсам нет. Только вирусы, кодирующие гликопротеины G-GNS, считаются официально идентифицированными. Виды (3 видов):

Название вида вируса Название на русском языке № генома Аббревиатура
Adelaide River virus Вирус реки Аделаида (Adelaide River) L09206, L09208, U05987, U10363 ARV
Berrimah virus Вирус Берримах -- BRMV
Bovine ephemeral fever virus Вирус эфемерной лихорадки КРС M94266, U04166, U18106, U72399 BEFV

Предполагаемые(3): Kimberley virus (KIMV) Malakal virus (MALV) Puchong virus (PUCV).

Род: Novirhabdovirus. Типовой вид: Infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) (вирус инфекционного гематопоэтического некроза).

Характерные особенности. Род включает одну из двух подгрупп рабдовирусов, инфицирующих хозяев, обитающих в воде. Представители другой подгруппы (представляемой Spring viremia of carp virus), на основе доступных данных по сиквенсам, получили статус предполагаемых видов рода Vesiculovirus. Температура, необходимая для репродукции, обычно 15-28 оС, а температура инактивации значительно ниже, чем для других рабдовирусов, что связано с особенностью хозяев, являющихся пойкилотермными животными, и их географическим распространением. Вирионы содержат 5 структурных протеинов: L (Mr 150-225 x 103), G (Mr 63-80 x 103), N (Mr 38-47 х 103), P (Mr 22-26 x 103), обозначаемый ранее как М1, и M (Mr 17-22 x 103), обозначаемый ранее как М2. Определен один небольшой неструктурный протеин NV (Mr 12-14 x 103), экспрессируемый инфицированными клетками, но отсутствующий в очищенных вирионах. Между видами уровень гомологии данного протеина значительно меньше, чем других. Геном (11,1 kb) содержит 6 генов (в порядке: 3’-N-P-M-G-NV-L-5’). Для IHNV известно, что геном содержит лидерный участок (около 60 нуклеотидов), предшествующий участку начала транскрипции гена N, и участок, следующий за сайтом терминации транскрипции гена L. Гены начинаются либо с предполагаемого консервативного сигнала начала транскрипции 3’-CCRWG (vРНК чаще: 3’-CCGUG), либо с сигнала 3’-UUGU, который также найден у большинства генов выше сайта инициации трансляции. Сигнал терминации транскрипции – 3’-ACURUC(U)7, а длина межгенных участков – 1 нуклеотид (G или А).

Биологические особенности. Новирабдовирусы инфицируют многие виды рыб. Спектр естественных хозяев отдельных видов достаточно широк, часто включая несколько разных видов рыб (например, лосесевых и сельдевых). Передаются горизонтально (через воду). Отмечены случаи распространения вируса через контаминированную икру. Естественными резервуарами вирусов считаются рыбы, живущие в естественных условиях. Предполагается о существовании беспозвоночных переносчиков, но их роль пока не ясна. Показано вирусоносительство рыб, после переболевания, вызванного IHNV, но значимость данного феномена тоже не ясна.

Новирабдовирусы имеют широкое географическое распространение. IHNV энзоотичен на западе Северной Америки, однако случайная транспортировка контаминированной вирусом икры и инфицированной рыбы привели к распространению вируса в Европе, Корее, Тайвани, Японии и Китае. VHSV энзоотичен в Западной Европе, Северо-Восточной части Тихого океана, Балтийском и Северном морях. Hirame rhabdovirus (HIRRV) выделен только в Японии. Виды данного рода вызывают экономически значимые болезни у культивируемых рыб. Вспышки болезней, обусловленных IHNV и VHSV, сопровождались гибелью 50-100% поголовья лососевых, разводимых в искусственных условиях. Сообщалось об эпизоотиях, вызванных IHNV, среди дикоживущих лососевых. IHNV и VHSV вызывают болезнь, сопровождающуюся геморрагическими петехиями на внешней поверхности и внутренних органах. При гистоисследовании наибольшие дегенеративные изменения и некрозы обнаруживаются в почках, и гематопоэтической ткани.

Критерии подразделения на виды внутри рода. Внутри рода виды могут быть определены серологически, на основе перекрестной нейтрализации с использованием поликлональной кроличьей антисыворотки. Штаммы внутри вида нейтрализуются одной антисывороткой. IHNV и HIRRV представляют собой отдельные серотипы, а VHSV имеет один мажерный серотип с небольшим числом штаммов. Вирусы разных видов не проявляют перекрестной нейтрализующей активности, хотя при анализе в Western-blot слабая активность может проявляться со специфическими протеинами. Анализ нуклеотидных сиквенсов совпадает с разделением на виды на основе серологичесих данных. Для штаммов одного вида различия по нуклеотидному сиквенсу составляют 3-4% для генов G и NV IHNV и 18% для гена G Европейских и Северо-Американских VHSV. Идентичность по аминокислотному сиквенсу протеина N между IHNV и VHSV составляет примерно 34%. Виды (3 видов):

Название вида вируса на русском языке № генома в генбанке Аббр-ра
Hirame rhabdovirus Рабдовирус Хирам D45422, U24073,U47847 HIRRV
Infectious hematopoietic necrosis virus Вирус инфек гемато- поэтического некроза L40883,M16023,U47846, U50401, U50402,X89213 IHNV
Viral hemorrhagic sept icemia virus (Egtved virus) Вирус геморрагической септицемии (Вирус Эгтвед) D00687,U02624,U02630, U03502,U03503,U28745, U28746, X59241 VHSV

Предполагаемые виды (3): Eel virus B12 (EEV-B12), Eel virus C26 (EEV-C26) Snakehead rhabdovirus(SHRV).

Неклассифицированные виды семейства. Известно 6 серогрупп рабдовирусов животных (всего 20 видов), не включенных в данные роды, а также ряд негруппированных вирусов (37 вирусов животных и 58 вирусов растений).

Филогенетическое родство внутри семейства. Для протеинов G показана относительно низкая идентичность сиквенсов разных представителей семейства, что не позволяет их использовать для универсального определения филогенетического родства. Сиквенс протеина L наиболее консервативен, но данных пока недостаточно. Филогенетическое родство, основанное на анализе сиквенса протеина N (119 аминокислот), показало, что наибольшее родство имеют везикуло- и эфемеровирусы.

Сходство с другими таксонами. Рабдовирусы имеют общие признаки с представителями семейств Filoviridae и Paramyxoviridae порядка Mononegavirales: геном представлен РНК (несегментированная, одноцепочечная, с негативной полярностью, неинфекционная), спиральный нуклеокапсид, первичная транскрипция инициируется вирусной РНК-зависимой РНК полимеразой, сходная организация генома, один 3’-промотор с коротким концевым нетранскрибируемым участком, межгенные участки. Вирионы представляют собой крупные оболочечные структуры с характерной бахромой выступов. Реплицируются в цитоплазме, почкование происходит в основном через плазматическую мембрану, за исключением вируса бешенства, который иногда почкуется через внутренние мембраны, и рабдовирусов растений из рода Nucleorhabdovirus, которые почкуются через внутреннюю ядерную мембрану. Транскрибируют дискретные непроцессируемые мРНК.

ВЕЗИКУЛЯРНЫЙ СТОМАТИТ

Vesicular stomatitis (антл), Stomatite vesiculouse (франц), Stomatitis vesicularis (нем)

Везикулярный стоматит (ВС) - остропротекающая болезнь лошадей, мулов, КРС и сви­ней, проявляющаяся образованием везикул в ротовой полости, поражением сосков вымени, реже тканей области межкопытной щели, венчика и мякишей. Протекает в виде энзоотиче­ских вспышек или эпизоотии. Болезнь впервые диагностировали в Южной Америке в 1802 г В 1915-1917 гг.. она возникла из Канады во Францию, затем ее регистрировали в Германии, Англии, Италии, в 1939 г. обнаружена среди лошадей и КРС в Аргентине, в 1944 г - в Венесуэле среди лошадей и свиней В 1949 г в США эпизоотия охватила 14 штатов В 1950 г болезнь распространилась в Мексике За последн.ие годы ВС наблюдается в Северной и Южной Америке, Англии, Франции, Италии, Индии, Китае В РН ВНА к вирусу типа Индиана выявлены в большом проценте случаев у животных, живущих на деревьях, а к вирусу типа Нью-Джерси - у грызунов. У домашних животных и людей титры AT высоки к обоим типам вируса.


Дата добавления: 2014-12-11 | Просмотры: 1095 | Нарушение авторских прав



1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 |



При использовании материала ссылка на сайт medlec.org обязательна! (0.009 сек.)