ТАКСОНОМИЯ И классификациЯ вирусов
Вирусология — наука, изучающая морфологию, физиологию, генетику, экологию и эволюцию вирусов.
Термин «вирус» применил еще Л. Пастер для обозначения заразного начала. В настоящее время под вирусом подразумеваются мельчайшие реплицирующиеся микроорганизмы, находящиеся всюду, где есть живые клетки.
Открытие вирусов принадлежит русскому ученому Дмитрию Иосифовичу Ивановскому, который в 1892 г. опубликовал работу по изучению мозаичной болезни табака. Д.И. Ивановский показал, что возбудитель этой болезни имеет очень малые размеры и не задерживается на бактериальных фильтрах, являющихся непреодолимым препятствием для мельчайших бактерий. Кроме того, возбудитель мозаичной болезни табака не способен культивироваться на искусственных питательных средах. Д.И. Ивановский открыл вирусы растений. Известный датский ботаник М. Бейеринк подтвердил эксперименты Д.И. Ивановского в 1893 г. Он рассматривал идею «вируса» в контексте заразного начала «contagium vivum fluidum (живой, растворимый микроб)».
В 1898 г. Ф. Леффлер и П. Фрош показали, что широко распространенная болезнь крупного рогатого скота — ящур, вызывается агентом, который также проходит через бактериальные фильтры. Этот год считается годом открытия вирусов животных.
В 1901 г. Рид и Кэррол показали, что фильтрующиеся агенты можно выделить и из трупов людей, умерших от желтой лихорадки. Этот год считается годом открытия вирусов человека.
Ф. Д’Эррель и Ф. Туорт в 1915-1917 гг. обнаружили вирусы у бактерий. Д’Эррель назвал их «бактериофагами» или пожирателями бактерий. Позднее были выделены вирусы грибов, простейших, насекомых.
Вирусы до сих пор остаются одними из главных возбудителей инфекционных и неинфекционных заболеваний человека. Более 1000 различных болезней имеют вирусную природу. Вирусы и вызываемые ими болезни человека являются объектом пристального изучения медицинской вирусологии.
Вирусы имеют кардинальные отличия от других прокариотических микроорганизмов:
1. Они не имеют клеточного строения. Это доклеточные формы биологической жизни.
2. Имеют субмикроскопические размеры, варьирующие у вирусов человека в пределах 15-250 и более нм.
3. Характеризуются только одним типом нуклеиновой кислоты: или ДНК, или РНК в качестве генома.
4. Вирусы не обладают собственными системами метаболизма и получения энергии.
5. Репликация вирусов происходит в клетках с использованием их белоксинтезирующих и энергетических систем, поэтому они — облигатные внутриклеточные паразиты.
6. Вирусы не способны к прогрессивному росту и делению. Они образуются в виде зрелых форм (вирионов) путем самосборки из готовых, т.е. преформированных компонентов (белков, нуклеиновых кислот).
В основу современной классификации вирусов положены следующие основные критерии:
1. Тип нуклеиновой кислоты (РНК или ДНК) и ее первичная структура — сиквенс (одно- или двунитчатая, линейная, циркулярная, непрерывная или фрагментированная).
2. Характеристика вирионов: наличие белковой оболочки (капсида) и/или дополнительной липопротеидной оболочки (суперкапсида), размер и морфология, тип симметрии.
3. Стратегия вирусного генома в клетке хозяина (т.е. используемый вирусом путь транскрипции, трансляции, репликации и выход из нее).
4. Антигенные и физико-химические свойства.
5. Феномены генетических взаимодействий.
6. Экологические взаимодействия (круг восприимчивых хозяев, ареал географического распространения).
7. Механизмы патогенности (характер изменений в клетках, образование внутриклеточных включений, изменения экспрессии генов клеток хозяина, апоптоз и трансформация клеток).
8. Способы передачи и резистентность к факторам внешней среды (γ-из-лучению, температуре, действию детергентов, эфира, противовирусным препаратам).
На основании 1 и 2 критериев вирусы делятся на подтипы, порядки и семейства, на основании других признаков — на роды и виды. Вид — наименьшая таксономическая единица. Существует в виде «квазивидов». Дополнительно по строению генома и антигенным вариациям различают подвидовые категории — типы, субтипы. Типы и субтипы имеют цифровое или буквенное обозначение. Например, серотипы полиовируса — 1, 2 и 3; генотипы вируса гепатита С — 1-6, субтипы — 1а и 1б и т.д.
Вид — группа вирусов, имеющих совпадающие характеристики (несколько главных свойств), составляющих реплицирующуюся линию.
Род — группа видов вирусов, имеющих общие свойства. Обычно формируется на основе типового вида, т.е. вида, по своим характеристикам и генетическим связям удовлетворяющего требованиям рода.
Семейство — совокупность родов вирусов с общими характеристиками. Формируется на основе типового рода.
Порядок — группа взаимосвязанных семейств вирусов (не полностью применимо в таксономии вирусов).
Другие таксоны, более высокого уровня (класс, отряд, царство), не применимы для вирусов.
Названия порядков, семейств, подсемейств, родов и видов пишется по латыни и начинается с большой буквы. Название порядка имеет суффикс «virales», а семейства оканчивается на «viridae». Некоторые семейства делятся на подсемейства и имеют суффикс «virinae», род — «virus» (например, Caudovirales, Adenoviridae, Mastadenovirus, Human adenovirus C).
В 1966 г. Комитет по Таксономии вирусов предложил первую унифицированную классификацию вирусов. В 1973 г. были расширены его права и он официально назван Международным Комитетом по Таксономии Вирусов (МКТВ). Комитет пересматривает классификацию каждые четыре года. Последняя классификация опубликована в 2000 г. Она включает классификацию 1550 вирусов, объединенных в 3 порядка, 56 семейств, 9 подсемейств и 203 рода. Мировая коллекция вирусов включает более 30 000 штаммов вирусов. Вирусы человека и животных распределены в 25 семействах: 15 — РНК-геном-ных и 10 — ДНК-геномных.
Классификация и некоторые свойства вирусов человека и животных представлены в таблице 1.
Таблица 1
Дата добавления: 2014-12-11 | Просмотры: 1464 | Нарушение авторских прав
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 |
|