22.11. Эквадро и Эвис (C.F. Aquadro, J. С. Avise, 1982, Genetics, 102, 269-284) методом последовательного электрофореза и тепловой денатурации исследовали три фермента в популяции хомячка Peromyscus maniculatus. При обычном электрофорезе были получены следующие частоты аллелей:
. Nat. Acad. Sei. USA, 79, 5631-5635) исследовали участок ДНК D. melanogaster длиной 12 000 п. н., содержащий локус Adh. Анализировали 18 геномов с использованием семи ферментов рестрикции, идентифицирующих 24 сайта. В отношении 20 сайтов все 18 геномов оказались одинаковыми, а в отношении остальных четы-
Got-1: 0,094 0,875 0,031
рех сайтов - полиморфными. Выявлено
Mdh-1: 0,969 0,031
7 гаплотипов, различающихся следую-
Est-1: 0,063 0,500 0,375 0,063
щим образом:
В локусах Got-1 и Mdh-1 криптических вариантов не обнаружилось, а в локусе Est-1 выявлены два дополнительных варианта: вместо двух, наиболее часто встречающихся аллелей, в действительности аллелей оказалось четыре с частотами 0,375; 0,125 и 0,188; 0,188. Рассчитайте увеличение гетерозиготности и эффективного числа аллелей для локуса Est-1 и для всех трех локусов. 22.12. Нуклеотидные различия в последовательностях ДНК можно оценить, не только точно определяя каждую последовательность, как это описано в тексте, но и воздействуя на ДНК эндонуклеазами рестрикции. Если в определенном сайте одна последовательность разрезается эндонуклеазой, а другая нет, то это означает, что две последовательности в этом сайте отличаются по крайней мере одной парой нуклеотидов (каждый такой сайт состоит из четырех или более соседних пар нуклеотидов). Ленгли и соавторы (С. H. Langley et al, 1982 Proc.
Для простоты предположим, что каждый сайт рестрикции состоит из 5 пар нуклеотидов, так что все 24 сайта содержат в сумме 120 п. н. Предположим также, что гаплотипы отличаются друг от друга только одним нуклеотидом (это предположение занижает оценку нуклеотидного разнообразия, поскольку некоторые гаплотипы отличаются более, чем одной парой нуклеотидов). Рассчитайте среднюю гетерозиготность на нуклеотид.