При изучении психических свойств, как и других признаков человека, разработаны и используются методы, которые позволяют компенсировать трудности анализа признака из-за малого числа детей в большинстве семей, невозможности наблюдения более чем за 1–3 поколениями вследствие длительности смены поколения (25–30 лет). Кроме того, большое число хромосом уменьшает возможность локализации отдельных генов на хромосомах, и на проявление признака влияет множество факторов среды.
При изучении наследования психических свойств человека используются методические подходы различных дисциплин. Генетическими такие работы делает специальная организация исследования и, в первую очередь, обследование родственников. В общем случае можно выделить следующие этапы проведения генетического исследования: планирование исследования, сбор необходимой информации о членах семьи на основе обследования родственников разными специалистами, анализ данных, генетическая интерпретация полученных результатов, научно-практические выводы и рекомендации.
Современное изучение наследственности психических свойств, а также роли средовых факторов в проявлении психических характеристик основано на комплексном применении различных методов генетики человека. Традиционно выделяют следующие методы, используемые в психогенетике: близнецовый, генеалогический, популяционный. В настоящее время используется также биохимический, молекулярно-генетический, цитогенетический, моделирование на животных. Такое выделение методов включает в себя разделение по объекту исследования (близнецы, семьи, популяции) и методикам исследования (биохимические, молекулярно-генетические, цитогенетические и т.д.). По-видимому, более обоснованным является выделение методов по объекту исследования, поскольку при изучении родственников могут использоваться самые различные методики обследования, например, психологические тесты, электроэнцефалография, компьютерная томография, анализ ДНК и т.д.
Современные психогенетические исследования характеризуются комплексным подходом к изучению наследственности психических свойств, при котором разноуровневое, мультидисциплинарное обследование позволяет приблизиться к пониманию причинно-следственных взаимосвязей при реализации наследственных факторов в формировании определенных психических свойств.