Филогенетическое родство внутри семейства. Семейство Herpesviridae составляют представители, отличающиеся широким разнообразием, но которые, в то же время, имеют сходную морфологию. Данные анализов, основанных на серологических исследованиях или гибридизации нуклеиновых кислот, редко имеют решающее значение при определении родства между вирусами. Возрастающее значение данных по сиквенсам способствовало широкому использованию сравнительного анализа сиквенсов с целью распределения герпесвирусов по таксонам и молекулярно-филогентического анализа семейства. Понятие отдельной генетической группы определялось по двум критериям: 1) сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей консервативных генов герпесвирусов и 2) идентификация отдельных уникальных генов. Тем не менее, некоторые вирусы были отнесены к определенным таксонам на основе серологического родства.
Использование данных критериев подкрепило достоверность существующей таксономической структуры семейства (подразделение на подсемейства). Однако на основе этих критериев были созданы дополнительные таксоны:
1) Gallid herpesvirus 2 (GaHV-2) и Gallid herpesvirus 3 (GaHV-3) (Marek’s disease virus type 1 and 3, соответственно) и Meleagrid herpesvirus 1 (MeHV-1) (Turkey herpesvirus) относятся к отдельной генетической группе внутри подсемейства Alfaherpesvirinae, так же как и Gallid herpesvirus 1 (GaHV-1) (Infectious laryngotracheitis virus), выделенный в отдельный таксон. Соответственно было создано два новых рода: “Marek’s disease-like viruses” и “Infectious laryngotracheitis-like viruses”.
2) Анализ сиквенса Ictalurid herpesvirus 1 (IcHV-1) (Channel catfish virus) показал лишь отдаленное родство данного вируса с герпесвирусами млекопитающих и птиц, и на данный момент он помещен в новый род, обозначенный“Ictalurid herpes-like viruses”, но еще не ратифицированный в качестве члена семейства.