АкушерствоАнатомияАнестезиологияВакцинопрофилактикаВалеологияВетеринарияГигиенаЗаболеванияИммунологияКардиологияНеврологияНефрологияОнкологияОториноларингологияОфтальмологияПаразитологияПедиатрияПервая помощьПсихиатрияПульмонологияРеанимацияРевматологияСтоматологияТерапияТоксикологияТравматологияУрологияФармакологияФармацевтикаФизиотерапияФтизиатрияХирургияЭндокринологияЭпидемиология
|
Ветеринарно – санитарная оценка продукции неразработана
Семейство: Retroviridae.
Таксономическая структура семейства.
Семейство: Retroviridae Рода: Alpharetrovirus, Betaretrovirus, Gammaretrovirus, Deltaretrovirus, Epsilonretrovirus, Lentivirus,Spumavirus
Характеристика вириона. Морфология. Вирион сферический (диаметр 80-100 нм) оболочечный, с гликопротеиновыми поверхностными выступами (8 нм в длину). Внутреннее ядро включает сферический нуклеокапсид (нуклеоид), расположенный эксцентрично у представителей рода Betaretrovirus, по центру – у Alpharetrovirus, Gammaretrovirus, Deltaretrovirus и Spumavirus, и в виде стержня или усеченного конуса у представителей рода Lentivirus. Существует два пути морфогенеза. Исторически, номенклатура, основанная на электронной микроскопии классифицировала членов родов Alpharetrovirus и Gammaretrovirus, которых сборка капсида происходит на плазматической мембране, как вирусы типа С. По отношению к членам рода Betaretrovirus сбрка их частиц типа А (незрелых капсидов) происходит в цитоплазме с последующим почкованием по морфологическому типу В (MMTV) или D (Mason-Pfizer monkey virus, M-PMV).
Вирионы чувствительны к нагреванию, детергентам и формальдегиду. Поверхностные гликопротеины могут быть удалены пртеолитическими ферментами. Относительно устойчивы к УФ облучению. Плавучая плотность 1,16-1,18 г/см3, S20w 600S (в сахарозе).
Геном. Геном представлен димером молекул РНК (мономер РНК: односпиральная, линейная с позитивной полярностью, размер 7-11 kb), составляющих 2% сухого веса вириона. Мономеры связаны друг с другм водородными связями. Каждый мономер полиаденилирован и кэпирован по 3’- и 5’-концу, соответственно. Очищенная вирусная РНК не инфекционна. Каждый мономер комплементарно ассоциирован со специфической молекулой тРНК, в области (называемой сайтом связывания с праймером – primer binding site), расположенной ближе к 5’-концу РНК, и около 18 оснований по 3’-концу тРНК. РНК и фрагменты ДНК, клеточного происхождения могут оказаться в составе вириона.
Другие компоненты вириона. Протеины составляют около 60% сухой массы вириона. Два оболочечных протеина: SU (surface – поверхностный) и TM (transmembrane – трансмембранный), кодируются вирусным геном env. Внутренние негликозилированные 3-6 структурных протеинов кодируются геном gag. Расположение от N-конца: (1) MA (matrix-матрикс), (2) протеин, обнаруженный у некоторых вирусов, с неопределенной функцией, (3) CA (capsid protein – капсидный протеин), (4) NC (nucleocapsid – нуклеокапсид). Протеин МА часто ацилирован, с меристиловой частью, ковалентно связанной с аминоконцевым глицином. К другим протеинам относятся: протеаза (PR, кодируемая геном pro), обратная транскриптаза (RT, кодируемая геном pol) и интеграза (IN, кодируемая геном pol). У некоторых вирусов присутствует dUTPase (DU), роль которого не ясна. Липиды составляют около 35% сухого веса вириона, и являются производными клеточной мембраны. Углеводы составляют 3% сухого веса вириона. Обычно оба (реже один) поверхностных оболочечных протеина гликозилированы. В вирусной оболочке также обнаруживаются клеточные гликолипиды.
Организация генома и репликация. Вирион несет две копии генома. Инфекционный вирус имеет 4 основных гена, кодирующих вирусные протеины в следующем порядке: 5’- gag-pro-pol-env -3’. Некоторые ретровирусы содержат гены, кодирующие неструктурные протеины, играющие важную роль в регуляции экспрессии генов и репликации вируса. Другие могут нести влияющие на патогенез последовательности клеточного происхождения, которые могут быть включены в полноразмерный геном вируса (например, у вируса саркомы Рауса – Rouse sarcoma virus, RSV) или в виде замен при делециях вирусных последовательностей (например, у вируса саркомы мышей – Murine sarcoma virus). Такие делеции приводят к нарушению репликации вируса и зависят от нетрансформирующих вирусов-помощников, необходимых для образования инфекционного потомства. Во многих случаях последовательности клеточного происхождения образуют гибриды с генами вирусных структурных белков, которые транслируются в один химерный протеин.
Проникновение в клетку определяется взаимодействием гликопротеином вириона и специфическими рецепторами на клеточной поверхности, следствием чего является слияние вирусной оболочки и клеточной мембраны и эндоцитоз. Некоторые из клеточных рецепторов были идентифицированы. В проникновении вируса иммунодефицита человека (Human immunodificiency virus, HIV) в клетку принимают участие два рецептора: иммуноглобулин-подобный протеин с одним трансмембранным участком CD4 и хемокиновый рецептор, пронизывающий мембрану семь раз (CCR5 или CXCR4). Рецепторы для экотропных (Murine leukemia virus, MLV), амфотропных MLV и Gibbon are leukemia virus (GALV) связаны с участием в транспортировке мелких молекул и имеют сложную структуру с множественными трансмембранными доменами. Для вирусов лейкоза птиц (ALVs) идентифицировано два рецептора: для вирусов подгруппы А – мелкая молекула с одним трансмембранным доменом, отдаленно напоминающая клеточный рецептор для низкоплотностных липопротеинов, тогда как для вирусов подгруппы В – рецепторы семейства протеинов фактора некроза опухоли.
Репликация начинается с обратной транскрипции (при участии обратной транскриптазы, RT) вирионной РНК в кДНК, с использованием 3’-конца тРНК в качестве праймера. Синтез кДНК сопровождается разрезанием вирусной РНК (за счет RNAse H активности RT). Продукты гидролиза служат для первичного синтеза кДНК с негативной полярностью. Конечная форма двуспирального ДНК-транскрипта, образуемого из вирусного генома, содержит длинные концевые повторы (LTRs), состоящие из последовательностей с 3’- и 5’-концов вирусной РНК, фланкирующих сиквенс (R), обнаруженный по обоим концам РНК. Процесс обратной транскрипции характеризуется высокой частотой рекомбинации.
Ретровирусная ДНК интегрируется в хромосомную ДНК клетки, образуя провирус, при участии вирусного протеина IN. Слияние конца вирусной ДНК с клеточной сопровждается удалением двух оснований с концов вирусной ДНК и формированием короткого дуплекса клеточного сиквенса в сайте интеграции. Интеграция вирусного генома может происходить по многим сайтам клеточного генома. Однако однажды интегрировавшись, сиквенс уже не может изменить свою позицию внутри той же клетки. Карта интегрированного провируса колинеарна неинтегрированной вирусной ДНК. Интеграция предшествует вирусной репликации.
Интегрированный провирус транскрибируется клеточной РНК полимеразой II в вирионную РНК и мРНК в ответ на транскрипционный сигнал в вирусных LTRs. У вирусов некоторых родов транскрипция также регулируется вирусными трансактиваторами. В зависимости от вируса и генетической карты различают несколько классов мРНК. мРНК, включающая весь геном служит для трансляции генов gag, pro, pol (расположенных в 5’-половине РНК), продуктом которых является полипротеин-предшественник, разрезаемый до структурных протеинов, полимеразы, RT и IN, соответственно. Меньшие РНК, включающие 5’-конец генома, после сплайсинга с сиквенсом 3’-конца генома, и включающие ген env, участки U3 и R, транслируются в предшественники оболочечных протеинов. У вирусов, содержащих дополнительные гены, может происходить другой сплайсинг, но все такие РНК будут иметь общий 5’-концевой сиквенс. Спумавирусы уникальны в том, что могут использовать внутренний промотор, расположенный в гене env выше доступа к рамке считывания. Большинство первично транслированных продуктов представляют собой полипротеины, подвергающиеся протеолитическому разрезанию для приобретения функциональной активности. Продукты генов gag, pro и pol обычно являются вторичными после первичной трансляции продуктов. Для трансляции pro и pol используются обходные трансляционные терминирующие сигналы.
Сборка капсида происходит либо на плазматической мембране (вирусы большинства родов), либо как внутрицитоплазматические частицы (Betaretrovirus и Spumavirus), и высвобождаются из клетки почкованием. Полипротеиновый процессинг внутренних протеинов происходит попутно или последовательно с созреванием вириона.
Антигенные свойства. Протеины содержат типо- и группоспецифические антигенные детерминанты. Некоторые из типоспецифических детерминант участвуют в антитело-обусловленной нейтрализации вируса. Группоспецифические детерминанты являются общими у членов одной серогруппы или могут встречаться у членов разных серогрупп внутри рода. Показана слабая перекрестная активность между представителями разных родов. Эпитопы, определяющие Т-клеточный ответ обнаружены у многих структурных протеинов. Антигенные свойства неиспользуются в классификации вирусов.
Биологические особенности. Ретровирусы распространены среди позвоночных как экзогенные агенты. Эндогенные провирусы, являющиеся результатом произошедшего когда-либо инфицирования герминативных клеток, наследуются по законам Менделя. Ретровирусы связаны с различными болезнями: лейкемии, лимфомы, саркомы и другие опухолевидные процессы тканей мезодермального происхождения; карцинома печени, почек, молочных желез; иммунодифециты (СПИД); аутоиммунные болезни; болезнь нижних двигательных нервов и многие другие остро протекающие болезни. Некоторые ретровирусы непатогенны. Распространение может быть горизонтальное (через кровь, слюну, половые контакты и т.п.) и вертикальное (прямое инфицирование плода; инфицирование через молоко, или при прохождении через родовые пути). Эндогенные ретровирусы наследуются в виде провирусов.
Род: Alpharetrovirus. Типовой вид: Avian leukosis virus (ALV) (вирус лейкоза птиц).
Сборка вирусных частиц происходит на плазматической мембране, по морфологии С-типа. Молекулярная масса протеинов: МА ± 19х103; р10 ± 10х103; СА ± 27х103; NC ± 12х103; PR ± 15х103; RT ± 68х103; IN ± 32х103; SU ± 85х103; TM ± 37х103. Геном 7,2 кб (1 мономер). Расположение генов: gag-pro-pol-env. Дополнительных генов нет. LTR около 350 нуклеотидов, из которых 250 составляют участок U3, 20 – сиквенс R, 80 – участок U5. Вирусы широко распространены и являются экзо- и эндогенными вирусами уток и других видов птиц. Изоляты ALV подразделяются на подгруппы А-J по различию в используемых клеточных рецепторах. Отдаленное сходство сиквенсов выявлено у эндогенных вирусов птиц и млекопитающих. Инфекция ассоциируется с малигнизацией и другми болезнями (истощение, остеопороз). Выделено много онкоген-содержащих вирусов.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный сиквенс. Аминокислотный сиквенс (генных продуктов). Спектр естественных хозяев. Разный онкогенез (если есть).
Например, вирус лейкоза птиц может быть легко отличен от вируса саркомы Рауса, так как не имеет онкогена, и кодирует только gag, pol и env. Репликация дефектных альфаретровирусов может быть отличена от вируса саркомы Рауса по различным делециям участков генов gag, pol и env и наличию уникальных для каждого онкогенов. Вирус саркомы Рауса кодирует онкоген src, тогда как вирус миелобластоза птиц, например, кодирует онкоген myb. Спектр хозяев, определяемый взаимодействием поверхностных гликопротеинов и клеточных рецепторов обычно используется для определния штаммов внутри вида.
Виды (9 видов):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббревиа-ра
| Avian leukosis virus
Avian leukosis virus-RSA
Avian leukosis virus-HPRS103
| Вирус лейкоза птиц
Вирус лейкоза птиц-RSA
Вирус лейкоза птиц-HPRS103
|
M37980
Z46390
| ALV
ALV-A
ALV-J
| Онкогенсодержащие вирусы:
| Недефектные по репликации:
| Rouse sarcoma virus
Rouse sarcoma virus (Prague C)
Rouse sarcoma virus (Schmidt-Ruppin B)
Rouse sarcoma virus (Schmidt-Ruppin D)
| Вирус саркомы Рауса
Вирус саркомы Рауса (Prague C)
Вирус саркомы Рауса (Schmidt-Ruppin B)
Вирус саркомы Рауса (Schmidt-Ruppin D)
|
J02342
AF052428
D10652
| RSV
RSV-Pr-C
RSV-SR-B
RSV-SR-D
| Дефектные по репликации:
| Avian carcinoma Mill Hill virus2
| Вирус Милл Хилл карциномыптиц2
| К02082
| ACMHV-2
| Avian myeloblastosis virus
| Вирус миелобластоза птиц
| J02013
| AMV
| Avian myelocytomatosis virus 29
| Вирус миелоцитоматоза птиц 29
| J02019
| AMCV-29
| Avian sarcoma virus CT10
| Вирус саркомы птиц СТ10
| Y00302
| ASV-CT10
| Fujinami sarcoma virus
| Вирус саркомы Фуджинами
| J02194
| FuSV
| UR2 sarcoma virus
| Вирус саркомы UR2
| M1045
| UR2SV
| Y73 sarcoma virus
| Вирус саркомы Y73
| J02027
| Y73SV
| | | | | | | | | Род: Betaretrovirus. Типовой: Mouse mammary tumor virus (MMTV)(вирус опухоли молочной железы мыш).
Характерные особенности. Вирионы MMTV имеют морфологию типа В (эксцентрично расположенное ядро, выступы на поверхности вириона). Другие члены рода имеют морфологию типа D (менее плотные поверхностные выступы и цилиндрический кор). Сборка капсида происходит в цитоплазме (образуя структуру, называемую частицами типа А), после чего они транспортируются и отпочковываются через цитоплазматическую мембрану. Молекулярная масса протеинов: МА ± 10х103; р21 ± 21х103; СА ± 27х103; NC ± 14х103; DU; PR ± 15х103; RT; IN; SU ± 52х103; TM ± 36х103. Размер генома 8-10 kb (1 мономер). Организация для MMTV: gag-pro-pol-env-sag. У MMTV есть дополнительный ген sag, продуктом которого является суперантиген. У MMTV размер LTR составляет 1300 нуклеотидов, 1200 нуклеотидов, кодирующие регион U3, 15 нуклеотидов – R, 95-120 нуклеотидов – U5, длина которых у всех видов рода.
В данный род входят экзогенные, передающиеся вертикально (с молоком) и эндогенные вирусы мышей, так же как и экзогенные, передающиеся горизонтально, и эндогенные вирусы приматов и овец. Вирусы мышей ассоциированы с карциномой млочной железы и Т-лимфомами, тогда как экзогенные вирусы приматов ассоциированы с иммунодефицитными болезнями; Jaagsiekte virus (JSRV) ассоциирован с раком легких у овец. Онкоген-содержащие вирусы не выявлены.
Критерии подразделения на виды внутри рода.
Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный сиквенс. Аминокислотный сиквенс (генных продуктов). Спектр естественных хозяев.
Некоторые ретровирусы приматов довольно различны между собой, хотя и относятся к одному виду благодаря рекомбинации с геном env гаммаретровирусов. Наиболее дивергентные из них эндогенные Squirrel monkey retrovirus (SMRV) и Langur virus (LNGV), которые не могут инфицировать клетки из тканей органов приматов. Несколько серологически различных штаммов существует у вида Mason-Pfizer monkey virus (M-PMV). Mouse mammary tumor virus (MMTV) выделен как отдельный вид, благодаря наличию уникального участка, кодирующего sag и очень отличающегося гена env. Ovine pulmonary adenocarcinoma virus (JSRV) также выделен как отдельный вид на основе оценки степени нуклеотидной дивергенции. Сходные эндогенные провирусы были идентифицированы и у других млекопитающих (грызуны, приматы).
Виды (5 видов):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббревиа-а
| Langur virus
| Вирус Лангур
| --
| LNGV
| Mason-Pfizer monkey virus
Simian retrovirus 1
Simian retrovirus 2
| Вирус обезьян Месон-Пфайзер
Ретровирус обезьян 1
Ретровирус обезьян 2
| M12349
M11841
M16605
| M-PMV
SRV-1
SRV-2
| Mouse mammary tumor virus
| Вирус опухоли молочной железы мышей
| M15122
| MMTV
| Ovine pulmonary adenocarcinoma virus
(Jaagsiekte sheep virus)
| Вирус аденокарциномы легких овец
| M80216
| JSRV
| Squirrel monkey retrovirus
| Ретровирус белечьей обезьяны
| M23385
| SMRV
| Род: Gammaretrovirus. Типовой: Murine leukemia virus (MLV) (вирус лейкемии мышей).
Характерные особенности. Вирион имеет морфологию типа С, со слаборазличимыми поверхностными выступами. Плотный кор расположен в центре. Сборка капсида происходит на внутренней поверхности мембраны одновременно с почкованием. Молекулярная масса протеинов: МА ± 15х103; р12 ± 12х103; СА ± 30х103; NC ± 10х103; PR ± 14х103; RT ± 80х103; IN ± 46х103; SU ± 70х103; TM ± 15х103. Геном 8,3 kb; расположение генов: gag-pro-pol-env. Дополнительных генов нетРазмер LTR составляет 600 нуклеотидов, 500 нуклеотидов – регион U3, 60 нуклеотидов – R, 75 нуклеотидов – U5.
Вирусы широко распространены, экзогенные (передаются горизонтально и вертикально) и эндогенные вирусы встречаются у многих млекопитающих. Вирусы ретикулоэндотелиозов включают несколько видов, выделенных у птиц, не имеют сходных эндогенных последовательностей. Сходные эндогенные последовательности обнаружены у млекопитающих. Вирусы ассоциируются с рядом таких болезней как малигнизация, иммуносупрессия, нейрологические нарушения и др. Выделено много онкоген-содержащих вирусов млекопитающих и вирусов группы ретикулоэндотелиозов.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный сиквенс и вирусный онкогенез. Антигенные свойства. Спектр естественных хозяев. Патогенность.
Описаны вирусы ретикулоэндотелиозов млекопитающих, рептилий и птиц. Вирусы млекопитающих могут быть как способными к репликации и не имеющими онкогенов клеточного происхождения, так и дефектными по способности к репликации, имеющие разные клеточные онкогены.
Murine leukemia virus (MLV) может быть отличен от Gibbon ape leukemia virus (GALV) по дивергенции сиквенсов, различием в рецепторах, необходимых для проникновения в клетку, и ограниченной антигенной перекрестной реактивности в ELISA. Вирус саркомы мышей, дефектные по репликации отличается от MLVs и между собой по наличию клеточных онкогенов (Moloney sarcoma virus(mos) и Wooley monkey sarcoma virus (sis)) и потерей частей генов gag, pol, env.
Виды (17 видов):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббревиатура
| Группа вирусов млекопитающих
| Недефектные по репликации
| Feline leukemia virus
| Вирус лейкемии кошек
| M18247
| FeLV
| Gibbon ape leukemia virus
| Вирус лейкемии гиббонов
| M26927
| GALV
| Guinea pig type C oncovirus
| Онковирус типа С морских свинок
| M18247
| GPCOV
| Murine leukemia virus
Abelson Murine leukemia virus
AKR (endogenous) Murine leukemia virus
Friend Murine leukemia virus
Moloney Murine leukemia virus
| Вирус лейкемии мышей
Вирус лейкемии мышей Абелсон
Вирус лейкемии AKR (эндогенный) мышей
Вирус лейкемии мышей Френд
Вирус Молони лейкемии мышей
| J02255
J02009
J01998
M93134, Z11128
J02255
| MLV
AbMLV
AKRMLV
FrMLV
MoMLV
| Porcine type C oncovirus
| Онковирус типа С свиней
| --
| PCOV
| Дефектные по репликации
| Finkel-Biskis-Jinkins murine
sarcoma virus
| Вирус Финкел-Бискис-Джинкинссаркомы мышей
| К02712
| FBJMSV
| Gardner-Alstein feline sarcoma vi
| Вир Гарднер-Алстейнсаркомы кош
| --
| GAFeSV
| Hardy-Zukerman feline sarcoma
| Вир Харди-Зукерман саркомы кшк
| --
| HZFeSV
| Harvey murine sarcoma virus
| Вирус Харвей саркомы мышей
| --
| HaMSV
| Kirsten murine sarcoma virus
| Вирус Кирстен саркомы мышей
| --
| KiMSV
| Moloney murine sarcoma virus
| Вирус Молони саркомы мышей
| J02266
| MoMSV
| Snyder-Theilen feline sarcoma vir
| Вирус Снайдер-Тейленсаркомы кш
| --
| STFeSV
| Wooly monkey sarcoma virus
(Simian sarcoma virus)
| Вирус саркомы шерстистых обезьян
(Вирус саркомы обезьян)
| J02394
| WMSV
| Группа вирусов рептилий
| Viper retrovitus
| Ретровирус гадюк
| --
| VRV
| Группа вирусов (ретикулоэндотелиозов) птиц
| Chick syncytial virus
| Синцитиальный вирус цыплят
| --
| СSV
| Reticuloendotheliosis virus (strain T, A)
| Вирус ретикулоэндотелиоза,
| --
| REV
| Trager duck spleen necrosis virus
| Вирус некроза селезенки уток
| --
| TDSNV
| | | | | | | | | | | | | Род: Deltaretrovirus. Типовой: Bovine leukemia virus (BLV)(вирус лейкемии (лейкоза) КРС).
По морфологии и стратегии сборки вирион дельтаретровирусов сходен с таковым гаммаретровирусов: морфология типа С, слаборазличимыми поверхностными выступами, плотный кор расположен в центре; сборка капсида происходит на внутренней поверхности мембраны одновременно с почкованием. Молекулярная масса протеинов: МА ± 19х103; СА ± 24х103; NC ± 12-15х103; PR ± 14х103; RT; IN; SU ± 60х103; TM ± 21х103. Геном 8,3 kb; расположение генов: gag-pro-pol-env-tax-rex. Дополнительные гены: tax-rex, кодируют неструктурные протеины, участвующие в регуляции синтеза и процессинга вирусной РНК. Размер LTR составляет 550-750 нуклеотидов, 200-300 нуклеотидов – регион U3, 135-235 нуклеотидов – R, 100-200 нуклеотидов – U5. Экзогенные вирусы (с горизонтальной передачей) данного рода обнаружены только у небольшой группы млекопитающих. Родственных эндогенных вирусов не идентифицировано. Инфекции связаны с В- или Т-клеточными лейкемиями или лимфомами, так же как и с нейрологической болезнью (тропический спастический парапорез или HTLV-ассоциированная миопатия) с длительным латентным периодом с инцидентностью менее 100%. Онкоген-вирусов нет.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный сиквенс. Антигенные свойства. Спектр естественных хозяев. Патогенность. HTLV-1 и STLV-1 были отнесены в соответствующий кластер не по признаку спектра восприимчивых хозяев, а в соответствии с географическим распространением. Все описанные субтипы HTLV-1 наиболее вероятно возникли при межвидовой передаче от обезьян человеку. Например, Primate T-lymphotropic virus 1 (PTLV-1) отличается от Primate T-lymphotropic virus 2 (PTLV-2), впервую очередь, на основе филогенетических различий. Оба вируса имеют одинаковую кодирующую стратегию, но только PTLV-1 имеет отношение к болезни человека.
Виды (4 вида):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббре-ра
| Bovine leukemia virus
| Вирус лейкемии (лейкоза) КРС
| K02120
| BLV
| Primate Tlymphotropic virus 1
Human T-lymphotropic virus 1
Simian T-lymphotropic virus 1
| Тлимфотропный вирус приматов1
Т-лимфотропный вирус человека1
Т-лимфотропный вирус обезьян 1
|
D13784
| PTLV-1
HTLV-1
STLV-1
| Primate Tlymphotropic virus 2
Human T-lymphotropic virus 2
Simian T-lymphotropic virus 2
(Formely termed STLV-PP)
| Т-лимфотропный вирусприматов 2
Т-лимфотропный вирус человека 2
Т-лимфотропный вирусобезьян 2 (ранее называемый STLV-PP)
| M10060
| PTLV-2
HTLV-2
STLV-2
| Primate Tlymphotropic virus 3
Simian T-lymphotropic virus 3
(Formely termed STLV-L)
| Т-лимфотропный вирус приматов 3
Т-лимфотропный вирус обезьян 3 (ранее называемый STLV-L)
| Y07616
| PTLV-3
STLV-3
| Род: Epsilonretrovirus.
Типовой вид: Walleye dermal sarcoma virus (WDSV) (вир дермальной саркомы (глаукомы)).
Все представители рода являются экзогенными ретровирусами. Имеют сложную структуру. Размер генома 11,7-12,8 kb, расположение генов: gag-pro-pol-env-orfA-orfB; 1-3 ORFs, кодирующие преимущественно дополнительные протеины. ORFa (вирусный гомолог циклину D) присутствует у всех трех ретровирусов, вызывающих глаукому. Функции двух других ORFs у вирусов глаукомы или одной ORF у ретровируса змееголова не определены. Размер LTR ретровирусов рыб варьирует от 500 до 650 нуклеотидов, 450 нуклеотидов – регион U3, 80 нуклеотидов – R, 75 нуклеотидов – U5. Филогенетический анализ участка полимеразы показал, что ретровирусы глаукомы и окуней образуют группу вирусов, отличающихся от ретровирусов змееголова. Тем не менее, на данный момент, все ретровирусы рыб оказались в одной группе с ретровирусами типа С млекопитающих.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный сиквенс и вирусный онкогенез. Аминокислотный сиквенс продуктов генов. Спектр естественных хозяев.
Данный род состоит из трех видов ретровирусов рыб, различающиеся между собой на основе филогенетического разнообразия. В даный таксон включены два предполагаемых вида. С появлением дополнительных данных ретровирус змееголова может быть выделен в отдельный род. Вирус гиперплазии окуней был секвенирован только по гену полимеразы и остается в статусе предполагаемого, пока не будет получена дополнительная информация по сиквенсу.
Виды (3 вида):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббревиатура
| Walleye dermal sarcoma virus
| Вирус дермальной
саркомы (глаукомы)
| AF033822
| WDSV
| Walleye epidermal hyperplasia virus 1
| Вирус эпидермальной
гиперплазии (глаукомы) 1
| AF014792
| WEHV-1
| Walleye epidermal hyperplasia virus 2
| Вирус эпидермальной
гиперплазии (глаукомы) 2
| AF014793
| WEHV-2
| Предполагаемые виды (2): Perch hyperplasia virus (PHV) (вирус гиперплазии окуней)
Snakehead retrovirus (SnRV) [U26458] (ретровирус змееголова).
Род: Lentivirus. Типовой вид: Human immunodificiency virus 1 (HIV-1) вирус иммунодефицита человека 1.
Вирион имеет характерную морфологию, с прямоугольным или конусовидным кором (нуклеоидом). Сборка вириона происходит на клеточной мембране. Молекулярная масса протеинов: МА ± 17х103; СА ± 24х103; NC ± 7-11х103; PR ± 14х103; RT ± 66х103; DU (у всех кроме лентивирусов приматов); IN ± 32х103; SU ± 120х103; TM ± 41х103. Размер генома 9,3 kb; расположение генов: gag-pro-pol-vif-vpr-tat-rev-vpu-env-nef. Кроме основных генов gag-pro-pol-env присутствуют дополнительные гены (например для HIV-1: vif, vpr, tat, rev, vpu и nef), продукты которых участвуют в регуляции и синтезе вирусной РНК и других репликативных процессах. У других вирусов могут быть дополнительные гены неструктурных белков (например у HIV-2: vpx). Размер LTR 600 нуклеотидов, 450 нуклеотидов – регион U3, 100 нуклеотидов – R, 80 нуклеотидов – U5.
В состав рода входят экзогенные вирусы (с горизонтальной и вертикальной передачей) человека и многих других млекопитающих. О существовании родственных эндогенных вирусов сведений нет. Лентивирусы приматов отличаются по использованию хемокинового рецептора, протеина CD4 и по отсутствию DU. Некоторые группы проявляют перекрестную активность по антигенам Gag (лентивирусы овец, коз и кошек). Вирусы, родственные Feline immunodificiency virus (FIV) были выделены от других крупных кошачьих (например, Puma lentivirus), а наличие антител к антигену Gag у львов и других крупных кошачьих свидетельствует о существовании других вирусов, близких FIV и лентивирусам овец и коз. Вирусы ассоциируются с различными болезнями, включая иммунодефициты, нейрологические нарушения, артриты и др. Онкоген-вирусов нет.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный и аминокислотный сиквенс. Антигенные свойства. Спектр естественных хозяев. Патогенность.
На основе различий по спектру восприимчивых хозяев лентивирусы были подразделены на 5 групп (лентивирусы приматов, овец и коз, лошадей, кошек и КРС). Внтури группы лентивирусов приматов HIV-1 отличается от HIV-2, прежде всего по дивергенции нуклетидных сиквенсов, которая превышает 50%, и по наличию у HIV-2 гена vpx. Показана ограниченная перекрестная реактивность в ELISA на основе Gag-антигенов; по продукту гена env перекрестной активности нет.
Виды (10 видов):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома в
| Аббревиатура
| Группа лентивирусов КРС
| Bovine immunodeficiency virus
| Вирус иммунодефицита КРС
| M32609
| BIV
| Группа лентивирусов лошадей
| Equine infectious anemia virus
| Вирус инфекционной анемии лошадей
| M16575
| EIAV
| Группа лентивирусов кошек
| Feline immunodeficiency virus(Petu
| Вирус иммунодефицита кошек(Петулума)
| M25381
| FIV-P
| Felineimmunodeficiencyvirus(Oma)
| Вирус иммунодефицита кошек (Ома)
| FIU56928
| FIVO
| Puma lentivirus (PLV-14)
| Лентивирус пум (PLV-14)
| PLU03982
| PLV
| Группа лентивирусов овец и коз
| Caprine arthritis encephalitis virus
| Вирус артрита-энцефалита коз
| M33677
| CAEV
| Visna/Maedi virus (strain 1514)
| Вирус Висна-Мэди(штамм 1514)
| M60609
| VISNA
| Группа лентивирусов приматов
| Human immunodeficiency virus 1
Genomic clades of HIV-1
(examples):
Clade A:U455
Clade B: ARV-2/SF-2
BRU (LAI)
HXB2
RF
MN
Clade C: ETH2220
Clade D: NDK
ELI
Clade F: 93BR020
Clade H: 90CR056
Clade O: ANT70
| ВИЧ 1 (Генетические группы (clades) HIV-1, примеры вирусов каждой группы)
|
M62320
K02007
K02013
K03455
M17451
M17449
U46016
M27323
X04414
AF005494
AF005496
L20587
| HIV-1
HIV-1.U455
HIV-1.ARV-2/SF-2
HIV-1.BRU (LAI)
HIV-1.HXB2
HIV-1.RF
HIV-1.MN
HIV-1.ETH2220
HIV-1.NDK
HIV-1.ELI
HIV-1.93BR020
HIV-1.90CR056
HIV-1.ANT70
| Human immunodeficiency virus 2
Genomic clades of HIV-2
(examples):
Clade A: BEN
ISY
ROD
ST
Clade B: D205
EHOA
UC1
| ВИЧ 2(Генетические группы (clades) HIV-1, примеры вирусов каждой группы)
|
M30502
J04498
M15390
M31113
X61240
U27200
L07625
| HIV-2
HIV-2.BEN
HIV-2.ISY
HIV-2.ROD
HIV-2.ST
HIV-2.D205
HIV-2.EHOA
HIV-2.UCI
| Simian immunodeficiency virus
African green monkey (agm) SIVs
African green monkey TYO
African green monkey 155
African green monkey 3
African green monkey gr-1
African green monkey Sab-1
African green monkey Tan-1
chimpanzee SIV
mandrill SIV
red-capped mangabey SIV
sooty mangabey SIV-H4
*Rhesus (Maccaca mulatta)
*pig-tailed macaque
*stamp-tailed macaque (stm)
sykes monkey SIV
| Вирус иммунодефицита
обезьян (ВИО)
ВИО африканской
зеленой мартышки
ВИО африканской
зеленой мартышки TYO
ВИО африканской
зеленой мартышки 155
ВИО африканской
зеленой мартышки 3
ВИО африканской
зеленой мартышки gr-1
ВИО африканской
зеленой мартышки Sab-1
ВИО африканской
зеленой мартышки Tan-1
ВИО шимпанзе
ВИО мандрилл
ВИО дымчатого мангабея
ВИО-Н4 черного мангабея
ВИО макак резус
(Maccaca mulatta)
ВИО свинохвостых макак
ВИО медвежьих макак
ВИО белогорлых обезьян
|
X07805
M29975
M30931
M58410
U04005
U58991
X52154
M27470
AF028607
X14307
M195499
M32741
M83293
L06042
| HIV-2
SIV-agm.TYO
SIV-agm.155
SIV-agm.3
SIV-agm.gr
SIV-agm.sab
SIV-agm.tan
SIV-cpz
SIV-mnd
SIV-rcm
SIV-sm
SIV-mac
SIV-mne
SIV-stm
SIV-syk
| | | | | | | | | | | | * - описана межвидовая передача SIV-sm (у содержащихся в неволе).
Род: Spumavirus. Типовой вид: Chimpanzee foamy virus (CFV) (пенящий вирус шимпанзе).
Характерные особенности. Вирион имеет характерную морфологию, со слабозаметными поверхностными выступами и центральным неплотным ядром. Сборка капсида происходит в цитоплазме, после чего он отпочковывается в эндоплазматическую сеть или через плазматическую мембрану. Для почкования капсида необходим протеин Env. Нет сведений о разрезании в инфекционном вирионе протеина-предшественника Gag до субъединиц MA, CA, NC. Молекулярная масса протеинов: Gag-предшественник ± 74х103; N-концевой продукт разрезания Gag ± 70х103; Pol-предшественник ± 127х103; RT ± 80х103; IN ± 40х103; Env-предшественник ± 130х103; SU ± 80х103; TM ± 48х103; Itas/Bel ± 35х103; Bet (Bel-1/Bel-2 fusion protein) ± 60х103; Env-Bet fusion protein ± 170х103. Размер генома 11,6 kb; расположение генов: gag-pro-pol-env-tas-bet. Tas является ДНК-связывающим протеином с трансактиваторной функцией. Функции другого дополнительного протеина не известны. Размер LTR 1770 нуклеотидов, 1400 нуклеотидов – регион U3, 200 нуклеотидов – R, 150 нуклеотидов – U5. У вирусов КРС и кошек размер соответствует 950-1000 нуклеотидов. Спумавирусы могут использовать два сайта начала транскрипции: R в LTR и внутренний промотор (IP), расположенный выше дополнительных рамок считывания в гене env. Активность обоих промоторо зависит от Tas. Другим важным критерием отличия спумавирусов от представителей других родов семейства Retroviridae – экспрессия протеина Pol со сплайсированной субгеномной мРНК и присутствие в вирионе большого количества обратнотранскрибированной ДНК.
Вирусы распространены повсеместно, экзогенные, найдены у многих млекопитающих. Естественного инфицирования людей не зарегистрировано, отмечались редкие случаи заражения людей от нечеловекообразных обезьян. Есть данные о существовании родственных (но не близких) эндогенных вирусов. Многие изоляты вызывают характерную “пенистую” цитопатологию в культуре клеток. Болезней, ассоциированных со спумавирусной инфекцией, не отмечается. Онкоген-вирусов не обнаружено.
Критерии подразделения на виды внутри рода. Для подразделения на виды используются следующие критерии: Нуклеотидный и аминокислотный сиквенсы. Спектр естественных хозяев. Виды (5 видов):
Название вида вируса
| Название на русском языке
| № генома
| Аббревиатура
| Bovine foamy virus
| Пенящий вирус КРС
| U94514
| BFV
| Chimpanzee foamy virus
Chimpanzee foamy virus human isolate(formerly Human foamy virus, HFV)
| Пенящий вирус шимпанзе
Пенящий вирус шимпанзе, изолят от человека (ранее наз. Пенящий вирус человека)
| U04327
Y07725
| CFV
CFV/Hu
| Feline foamy virus
| Пенящий вирус кошек
| Y08851
| FFV
| Simian foamy virus 1
| Пенящий вирус обезьян 1
| Х54482
| SFV-1
| Simian foamy virus 3
| Пенящий вирус обезьян 3
| M74895
| SFV-3
| ЛЕЙКОЗ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
Leukaemia in cattle, Bovine leukosis (англ.); Leukose bovine (франц.)
Лейкоз КРС - хроническая инфекционная болезнь опухолевой природы, основной признак которой - злокачественное разрастание клеток кроветворных органов с нарушением их созревания, в результате чего происходит диффузная инфильтрация органов этими клетками или появляются опухоли. Само определение болезни обязывает выдвинуть проблему борьбы с этой инфекцией на первое место И, действительно, после опубликования серий работ о близком генетическом и АГ-родстве ВБЛ с вирусом Т-клеточного лейкоза человека (HTLV-1 и HTLV-2) диагностика и профилактика лейкоза КРС приобретают особую актуальность. Лейкозы животных диагностируют почти во всех странах мира. Широко распространены в США, ряде стран Европы, Африке и Австралии
Дата добавления: 2014-12-11 | Просмотры: 863 | Нарушение авторских прав
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 |
|