1. Фаза заражения (через комаров - спорозоитная инфекция или через кровь, внутриутробно, конгенитально - шизонтная инфекция).
2. Тканевая шизогония (инкубационный период).
3. Эритроцитарная шизогония (конец инкубации и весь период лихорадки).
4. Фаза повышенной иммунологической реактивности и нестойкой компенсации (короткий межприступный латент - от 2 недель до 2-3 месяцев; ранние рецидивы).
5. Фаза высокой иммунологической реактивности и полной компенсации (выздоровление, паразитоносительство).
6. Только при трехдневной и овале-малярии - при наличии брадиспорозоитов – возобновление тканевой, затем эритроцитарной шизогонии (поздние рецидивы).
7. Стойкие функционально-морфологические поражения внутренних органов- печени, селезенки, костного мозга (мета-малярийные заболевания).