При различных микозах поражаются разные ткани, поэтому материалом для лабораторной диагностики являются гной и мокрота, кровь и ликвор, желудочный и дуоденальный сок, желчь, испражнения, пораженные волосы, кожные и ногтевые чешуйки, пунктаты лимфатических узлов, костного мозга, внутренних органов, биопсированные кусочки из очагов поражения.
Микроскопическое исследование. Патологический материал предварительно исследуют в капле физиологического раствора. Для мацерации богатых кератином волос, кожных и ногтевых чещуек используют 10% раствор КОН или NaOH при подогревании в течение одной минуты, Мазки из патологического материала окрашивают по Граму, Цилю - Нильсену, Романовскому - Гимзе или метиленовым синим.
Культуральное исследование. Для каждой группы патогенных грибов требуются свои подходящие среды. Постоянно используются общепринятые плотные питательные среды: пробная Сабуро, пивное сусло, мясопептонный глюкозный агар с кровью.
Серологическое исследование. Осуществляется посредством реакции агглютинации и гемагглютинации, преципитации и связывания комплемента, иммунолюминесценции. Ни одна из серологических реакций не имеет решающего значения в диагностике соответствующих микозов. Отрицательные результаты серологических решений не всегда указывают на отсутствие микотической инфекции. Результаты серологических реакций ценны лишь при сопоставлении с данными микроскопического и культурального исследований.
Кожные пробы. Для выявления микотической аллергии используют разные препараты: взвеси из убитых культур соответствующих грибов, продукты их жизнедеятельности, полисахаридные и белковые извлечения из содержимого клеток и клеточных стенок гриба. Реакция на микотический аллерген проявляется немедленно (через 15-20 мин.) или замедленно - через 2-3 суток. Она проявляется покраснением, припухлостью, реже - некрозом; у некоторых лиц сопровождается недомоганием, повышением температуры, изменением картины крови, усилением воспалительных явлений в очагах поражений. Немедленную реакцию связывают с полисахаридным компонентом, а замедленную - с белковыми фракциями (считается более специфичной). Кожные пробы дольше сохраняется после перенесения глубоких поражений, слабее выражены и быстрее исчезают при поверхностных или очаговых поражениях кожи и слизистых.
Биологический метод. Заражение животных широко используется в диагностике глубоких и особо опасных микозов. Из лабораторных животных используют кроликов, морских свинок, крыс, мышей, собак, кошек, домашних птиц, золотистых хомячков.