В основе кислородзависимой внутриклеточной бактерицидности лежит образование активных форм кислорода (супероксид-анион радикалов ·О2, перекиси водорода – Н2О2, гидроксильных радикалов ОН; синглетного кислорода и гипохлористой кислоты – НОСl). Генерация этих соединений запускается процессом фагоцитоза, который сопровождается активацией окислительно-восстановительных ферментов, в первую очередь НАДФ-оксидазы фагосом, и получил название «дыхательного взрыва». Образовавшиеся активные производные кислорода высоко токсичны для большинства бактерий и грибов.
Важность этого механизма внутриклеточной бактерицидности может быть хорошо проиллюстрирована тем фактом, что дефект образования активных форм кислорода приводит к возникновению хронического гранулематоза. У таких больных резко возрастает чувствительность к грибковым и бактериальным инфекциям.
Другим важнейшим оксидативным механизмом внутриклеточной бактерицидности является образование окиси азота (NO). В результате активации через TLR, фагоцитарные рецепторы и рецепторы для цитокинов в нейтрофилах повышается уровень и активность ферментов, с участием которых осуществляется синтез NO, в первую очередь NO-синтетазы.
Окись азота оказывает сильное противомикробное действие за счет стимуляции перекисного окисления липидов клеточных стенок бактерий и грибов, повреждения ДНК патогенов, подавления активности гуанилатциклазы, цитохрома Р450 и других ферментов патогенов. Кроме того, при взаимодействии NO с производными серы, железа и кислорода образуются вещества, также оказывающие токсическое действие на клетки возбудителей. К ним относятся, например, двуокись азота (NO2), нитрозотиолы (RSNO) и нитрозильные соединения железа.
Окись азота также оказывает токсическое действие на паразитических червей и простейших.
Не-оксидативная защита от микробов осуществляется, когда гранулы нейтрофилов, в которых содержатся антимикробные пептиды, а также белки, обладающие бактерицидной активностью, и гидролитические ферменты, сливаются с фагосомами. Содержащиеся в этих гранулах дефенсины, кателицидин, а также недавно открытый белок BPI, обладающий высокой аффинностью к ЛПС стенки грамм-отрицательных бактерий, вызывают повреждение мембран бактериальных клеток. Гидролитические ферменты, также содержащиеся в первичных гранулах нейтрофилов (лизосомах), при образовании фаголизосомы и последующей активации вызывают гидролиз важнейших структурных компонентов бактерий.
Аналогичные механизмы внутриклеточной бактерицидности имеются также у клеток моноцитарно-макрофагального ряда.