ГЛАВА 10. НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ, ИХ СТРУКТУРА И СВОЙСТВА
Вопросы к занятию:
1. Пуриновые и пиримидиновые основания. Лактим-лактамная таутометрия.
2. Нуклеозиды: строение, строение и номенклатура. Рибонуклеозиды и дезоксирибонуклеозиды.
3. Нуклеотиды: строение и номенклатура.
4. Нуклеиновые кислоты: строение и биороль.
5. Строение нуклеозидомоно-, ди, трифосфатов. Аденозинтрифосфат.
6. Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК). Первичная и вторичная структура нуклеиновых кислот.
7. Рибонуклеиновая кислота (РНК), её строение.
8. Роль ДНК и РНК в биохимических процессах.
Нуклеиновые кислоты – сложные высокомолекулярные соединения, играющие важнейшую роль в жизнедеятельности организмов. Нуклеиновые кислоты были открыты более 130 лет назад (в 1869-1870гг.) немецким ученым Ф.Мишером, однако наиболее интересные данные, касающиеся их строения, свойств и биологической роли, были получены лишь в 20 веке, когда в биохимии и биологии стали широко применяться новейшие физические и химические методы исследований. Благодаря этому было установлено, что самые важные процессы жизнедеятельности – синтез белков, явления роста и размножения, передача наследственных свойств – происходят при участии нуклеиновых кислот.
Полимерные цепи нуклеиновых кислот построены из мономерных единиц - нуклеотидов, в связи с чем нуклеиновые кислоты называются полинуклеотидами. Нуклеиновые кислоты – биополимеры, молекулярная масса которых во многих случаях превышает молекулярную массу белков и часто исчисляется сотнями и миллионами.
Нуклеотиды представляют собой трехкомпонентное образование, включающее гетероциклическое основание, углеводный остаток и фосфатную группу, чем отличаются от обычно неделимых мономерных звеньев других полимеров. Общий вид структуры полинуклеотидной цепи следующий:
Высокомолекулярный характер, лабильность и большая сложность строения создает огромные трудности при изучении нуклеиновых кислот. В последние годы, однако, в этом направлении достигнуты существенные успехи: выяснен общий тип строения нуклеиновых кислот, расшифровано строение некоторых наиболее просто построенных нуклеиновых кислот (так называемых транспортных РНК), осуществлены принципиальной важности синтезы.
Нуклеиновые кислоты можно расщепить до мононуклеотидов; последние гидролизуются на пиримидиновые или пуриновые основания, рибозу (и дезоксирибозу) и фосфорную кислоту:
Нуклеиновая кислота → Мононуклеотиды → Основание + Рибоза (или дезоксирибоза) + Н3РО4.
Нуклеиновые основания. Являются производными азотсодержащих гетероциклических соединений — пиримидина или пурина. Пиримидиновые основания, выделенные в составе полинуклеотидных цепей ДНК, представлены тимином и цитозином; в составе РНК — урацилом и цитозином. Данные соединения обнаруживают способность к лактим-лактамной и амин-иминной таутомерии:
лактимная форма лактамная форма
Урацил
(2,4-диоксипиримидин)
Тимин
(2,4-диокси-5-метилпиримидин)
аминная форма иминная форма
Цитозин (4-амино-2-оксипиримидин)
Аденин и гуанин являются представителями пуриновых нуклеиновых оснований:
Гуанин (оксо-форма) Аденин (амино-форма)
(2-амино-6-оксопурин) (6-аминопурин)
Следует отметить, что пиримидиновые и пуриновые основания в составе полинуклеотидов представлены лактамной (оксо) и иминной формами, что обусловлено возможностью образования водородных связей между остатками оснований в цепях нуклеиновых кислот: тимин – аденин и цитозин – гуанин в ДНК; урацил – аденин и цитозин – гуанин в РНК.
Углеводными компонентами мононуклеотидов обычно являются D-рибоза (в форме β-D-рибофуранозы) и β-D-2-дезоксирибоза, в редких случаях глюкоза. Таким образом, пентозы в состав нуклеотидов входят в виде фуранозной формы с β-конфигурацией аномерного атома углерода – С1.
|
|
| β-D-рибоза
|
| β-D-дезоксирибоза
| Нуклеозиды. От нуклеотида можно отщепить фосфорную кислоту и получить нуклеозид, состоящий из пуринового или пиримидинового основания и пентозы. По своему химическому строению нуклеозиды являются гликозидами β-D-рибозы или дезоксирибозы. N-гликозидная связь образуется между аномерным атомом С1 в углеводе и атомом азота нуклеинового основания: у пиримидиновых оснований это N1 и у пуриновых – N9. При этом всегда образуется β-гликозидная связь.
В зависимости от природы углеводного остатка (пентозы) различают рибонуклеозиды и дезоксирибонуклеозиды.
В состав дезоксирибонуклеиновых кислот (ДНК) входят следующие нуклеозиды:
Дезоксигуанозин Тимидин (Тимидилдезоксирибозид)
Дезоксицитидин Дезоксиаденозин
В состав рубонуклеиновых кислот (РНК) входят нуклеозиды, являющиеся N-гликозидами D-рибозы. Их структурные формулы представлены ниже:
Цитидин Уридин
Аденозин Гуанозин
Названия нуклеозидов производятся от тривиального названия соответствующего гетероциклического азотистого основания с суффиксами -идин у пиримидиновых и -озин у пуриновых нуклеозидов. Исключение их этого правила сделано для нуклеозидов тимина.
Компоненты нуклеозида
| Нуклеозид
| Индекс нуклеозида
| Аденин + рибоза
| Аденозин
| А
| Аденин + дезоксирибоза
| Дезоксиаденозин
| dA
| Гуанин + рибоза
| Гуанозин
| Г
| Гуанин + дезоксирибоза
| Дезоксигуанозин
| dГ
| Цитозин + рибоза
| Цитидин
| С
| Цитозин + дезоксирибоза
| Дезоксицитидин
| dС
| Урацил + рибоза
| Уридин
| U
| Урацил + дезоксирибоза
| Дезоксиуридин
| dU
| Тимин + рибоза
| Риботимидин
| Т
| Тимин + дезоксирибоза
| Тимидин
| dТ
|
Нуклеозиды чаще обозначаю сокращенно однобуквенным индексом, но существует также система трехбуквенного индекса.
Нуклеозиды, являясь N-гликозидами, устойчивы к гидролизу в слабощелочной среде, но расщепляются в кислой среде. Пуриновые нуклеозиды гидролизуются легко, пиримидиновые — труднее.
Нуклеотиды. С химической точки зрения нуклеотиды являются фосфатами нуклеозидов, так как при образовании нуклеотида возникает сложноэфирная связь между фосфорной кислотой и гидроксильной группой в положении С5 или С3 пентозного остатка. В связи с наличием в молекуле остатка фосфорной кислоты нуклеотиды проявляют свойства двухосновной кислоты с рК1= 0,9 - 1,5 и рК2 = 6 - 6,5. Примеры нуклеотидов представлены на рис.
|
|
| аденозин-1-рибо-3-монофосфат (АМФ)
|
| гуанозин-1-рибо-2-дифосфат (ГДФ)
|
|
|
| аденозин-1-дезокси-3-монофосфат (АДФ)
|
| Гуанозин-1-дезокси-3-дифосфат (ГДФ)
|
В зависимости от строения углевода различают рибонуклеотиды (мономеры РНК) и дезоксирибонуклеотиды (мономерные звенья ДНК). В состав РНК входят: цитидинмонофосфат (ЦМФ), уридинмонофосфат (УМФ), аденозинмонофосфат (АМФ) и гуанозинмонофосфат (ГМФ). Нуклеотидный состав ДНК представлен дезоксицитидинмонофосфатом (дЦМФ), дезокситимидинмонофосфатом (дТМФ), дезоксиаденозинмонофосфатом (дАМФ) и дезоксигуанозинмонофосфатом (дГМФ) Нуклеотиды называют или как соответствующие кислоты (монозамещенные производные фосфорной кислоты), или как соли (монофосфаты) с указанием в обоих случаях положение фосфатного остатка:
Названия нуклеотидов:
как кислот
| как солей
| 5'-Адениловая кислота
| Аденозин-5'-фосфат
| 5'-Гуаниловая кислота
| Гуанозин-5'-фосфат
| 5'-Цитидиловая кислота
| Цитидин-5'-фосфат
| 5'-Уридиловая кислота
| Уридин-5'-фосфат
| 5'-Тимидиловая кислота
| Тимидин-5'-фосфат
|
Дата добавления: 2015-02-06 | Просмотры: 1582 | Нарушение авторских прав
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 |
|