2.1. Отделение антропонозных инфекций осуществляет организационно-методическое руководство, слежение за мероприятиями по профилактике и предупреждению распространения инфекционных заболеваний. Проводит анализ заболеваемости, мониторинг иммуноструктуры населения по курируемым заболеваниям, мониторинг за циркуляцией возбудителей курируемых инфекций во внешней среде, установление причинно-следственных взаимосвязей между показателями заболеваемости и показателями, характеризующими отдельные параметры среды обитания.
2.2. Организует эпидемиологический надзорза курируемыми инфекциями в общей системе социально-гигиенического мониторинга, оказывает методическую, консультативную и практическую помощь по курируемым инфекциям.
2.3. Осуществляет обеспечение органов, предприятий, учреждений и организаций, независимо от их подчиненности и форм собственности, а также граждан информацией, полученной при осуществлении эпидемиологического надзора за инфекционными заболеваниями
2.4. Готовит предложения по вопросам профилактики инфекционной заболеваемости для принятия решений органами власти и Управлением Федеральной службы по вопросам защиты прав потребителей и благополучия человека.
2.5. По поручению Управления участвует в осуществлении госсанэпиднадзора за предприятиями, учреждениями в части соблюдения противоэпидемического и санитарно-гигиенического режимов по профилактике инфекционных заболеваний.