Молекулярно-генетичні методи
Для виявлення та ідентифікації бактерій, вірусів, грибів і найпростіших останнім часом почали широко використовувати молекулярно-генетичні методи.
Реакція гібридизації ДНК і РНК (реакція генних зондів). Послідовність нук-леотидів ДНК і РНК є унікальною для геномів всіх мікроорганізмів. Будь-яку ділян-ку нуклеїнової кислоти можна визначити за допомогою комплементарної копії ДНК чи РНК, міченої ферментом або радіоактивною міткою (ДНК- і РНК-зонди). Такі зонди отримані для більшості патогенних бактерій і вірусів. За їх допомогою проводять ідентифікацію ДНК або РНК збудників бактеріальних і вірусних інфекцій у клінічному матеріалі. Реакція молекулярної гібридизації є дуже чутли-вою і високоспецифічною. Вона дає змогу виявляти ДНК або РНК в дуже малих кількостях (1-10 пг).
Методика реакції генних зондів зводиться до того, що виділені з патологіч-ного матеріалу ДНК або РНК збудників денатурують і наносять на спеціальні мем-брани з нітроцелюлози. Після чого вносять ДНК- або РНК-зонди, витримують певний час, роблять багаторазову промивку, щоб видалити реагенти, що не проре-агували. Якщо використовували зонди з радіоактивною міткою, результат визначають за допомогою γ-лічильника. У випадку, ко л и зонд мічений ферментом (наприк-лад, пероксидазою), то до такого зонда додають субстрат (наприклад, ортофеніл-діамін). Ферментація субстрату призводить до зміни кольору, який можна спосте-рігати неозброєним оком.
Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР) – один із найновіших методів вияв-лення та ідентифікації бактерій і вірусів у досліджуваних матеріалах. Принцип реакції базується на багаточисленному копіюванні (селективній ампліфікації) до-сліджуваної ДНК ферментом ДНК-полімеразою. Утворені копії ДНК ідентифіку-ють за допомогою методу електрофорезу.
Реакцію проводять в три етапи. На першому етапі при температурі 95 °С про-ходить денатурація двониткової молекули ДНК, її розплетення і розходження ниток.
Частина І. Загальна мікробіологія
На другому етапі (ренатурація) відбувається гібридизація праймерів, тобто утворення дволанцюгових комплексів праймер-матриці, які необхідні для ініцію-вання синтезу ДНК. Температура суміші при цьому знижується до 55 °С.
На етапі синтезу (75 °С) проходить подовження комплементарних ниток ДНК за допомогою ферменту ДНК-полімерази. Проводять 15-35 циклів синтезу.
Багаторазове повторення приводить до збагачення ДНК у досліджуваному матеріалі.
Метод ПЛР дуже чутливий. Його використовують для виявлення будь-якого інфекційного агента, якщо відома нуклеотидна послідовність гена (або його фрагмен-та), специфічного виключно до даного збудника. Доцільно використовувати ПЛР у тих випадках, коли бактерії чи віруси мають високу мінливість і знаходяться у до-сліджуваному матеріалі в малій кількості (навіть одна молекула геномної ДНК).
Зараз ПЛР належить до високоефективного молекулярно-генетичного методу, який доступний багатьом лабораторіям. Тривалість дослідження становить 2-3 години. Особливо доцільно використовувати його при визначенні та ідентифікації збудників туберкульозу, сифілісу, гонореї, мікоплази, вірусів СНІДу, герпесів, ге-патитів, рота- та ентеровірусів.
Розділ 5
Дата добавления: 2015-09-03 | Просмотры: 876 | Нарушение авторских прав
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 | 49 | 50 | 51 | 52 | 53 | 54 | 55 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 63 | 64 | 65 | 66 | 67 | 68 | 69 | 70 | 71 | 72 | 73 | 74 | 75 | 76 | 77 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 86 | 87 | 88 | 89 | 90 | 91 | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 110 | 111 | 112 | 113 | 114 | 115 | 116 | 117 | 118 | 119 | 120 | 121 | 122 | 123 | 124 | 125 | 126 | 127 | 128 | 129 | 130 | 131 | 132 | 133 | 134 | 135 | 136 | 137 | 138 | 139 | 140 | 141 | 142 | 143 | 144 | 145 | 146 | 147 | 148 | 149 | 150 | 151 | 152 | 153 | 154 | 155 | 156 | 157 | 158 | 159 | 160 | 161 | 162 | 163 | 164 | 165 | 166 | 167 | 168 | 169 | 170 | 171 | 172 | 173 | 174 | 175 | 176 | 177 | 178 | 179 | 180 | 181 | 182 | 183 | 184 | 185 | 186 | 187 | 188 | 189 | 190 | 191 |
|